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西岩

金虫 (小有名气)

[交流] 用过的比较好的能做Gene Interaction Network图的软件或网址? 已有2人参与

大家都用过哪些比较好的能做Gene Interaction Network图的软件呢,或者网址也可以。
http://avis.princeton.edu/pixie/index.php可以做基因相互作用网络关系图,但是图不够清晰,求好的软件或网址推荐。谢谢啦
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长路漫浩浩
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cluade

银虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
如果使用GeneMania的话,是可以直接存为SVG格式的图片的。
而对bioPIXIE而言,实在不行,可以下载“View All Interactions”,然后再在本地机上用Cytoscape等软件进行图示。
4楼2012-07-22 18:55:49
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cluade

银虫 (初入文坛)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
yqbter: 金币+2, 鼓励发帖! 2012-07-22 21:11:35
照理说SVG的格式,应该不会不清楚啊。
你试试http://www.genemania.org/这个网站,看是否有用。
2楼2012-07-20 20:45:43
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西岩

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cluade at 2012-07-20 20:45:43
照理说SVG的格式,应该不会不清楚啊。
你试试http://www.genemania.org/这个网站,看是否有用。

在网页上看的时候bioPIXIE是挺方便的,但是如果我想把相互作用的关系图截图下来的话就看不清了。
Cluade你是做生物信息学的吗?请问一下如果想存储这类相互关系图的图片有什么好的方法么?  谢谢啦
长路漫浩浩
3楼2012-07-21 09:00:09
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西岩

金虫 (小有名气)

送鲜花一朵
嗯  用了GeneMania,帮了我大忙啦,多谢Cluade筒子  O(∩_∩)O~
长路漫浩浩
5楼2012-07-23 10:48:46
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