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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 用过的比较好的能做Gene Interaction Network图的软件或网址？
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西岩

金虫 (小有名气)

[交流] 用过的比较好的能做Gene Interaction Network图的软件或网址？ 已有2人参与

大家都用过哪些比较好的能做Gene Interaction Network图的软件呢，或者网址也可以。
http://avis.princeton.edu/pixie/index.php可以做基因相互作用网络关系图，但是图不够清晰，求好的软件或网址推荐。谢谢啦
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西岩

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长路漫浩浩
1楼 2012-07-19 19:19:49
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cluade

银虫 (初入文坛)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
yqbter: 金币+2, 鼓励发帖！ 2012-07-22 21:11:35
照理说SVG的格式，应该不会不清楚啊。
你试试http://www.genemania.org/这个网站，看是否有用。
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2楼2012-07-20 20:45:43
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西岩

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by cluade at 2012-07-20 20:45:43
照理说SVG的格式，应该不会不清楚啊。
你试试http://www.genemania.org/这个网站，看是否有用。

在网页上看的时候bioPIXIE是挺方便的，但是如果我想把相互作用的关系图截图下来的话就看不清了。
Cluade你是做生物信息学的吗？请问一下如果想存储这类相互关系图的图片有什么好的方法么？  谢谢啦
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长路漫浩浩
3楼2012-07-21 09:00:09
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cluade

银虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
如果使用GeneMania的话，是可以直接存为SVG格式的图片的。
而对bioPIXIE而言，实在不行，可以下载“View All Interactions”，然后再在本地机上用Cytoscape等软件进行图示。
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4楼2012-07-22 18:55:49
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西岩

金虫 (小有名气)
送鲜花一朵
嗯  用了GeneMania，帮了我大忙啦，多谢Cluade筒子  O(∩_∩)O~
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长路漫浩浩
5楼2012-07-23 10:48:46
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进不出的再见
6楼2012-07-25 10:40:18
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