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汕头大学海洋科学接受调剂
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gongyiweimu

木虫 (著名写手)

[交流] 物质在溶剂中的可溶性模拟 已有8人参与

在做分子在气态及水中的模拟,发现不溶于水的物质也可以计算。吃饭的时候想到是否可以模拟物质在溶剂中是否可溶?溶解度是多少?物质在溶剂中溶解要关注哪些参数?准备好好看看溶剂模型的资料。
    以前判断一种物质都是看它亲水疏水的基团情况,不能较准确的判断。请大家推荐一下与物质在溶剂中溶解的相关资料,最好是理论模拟的。非常感谢!

[ 来自科研家族 木虫量化 ]
感谢大家的帮助,特别感谢vigaryang 和ChemiAndy 。vigaryang 说COSMO-RS方法可以。我查找后,发现在ADF中COSMO-RS方法确实可以,下面是我复制宏剑页面上的介绍,希望对感性趣的人有用:http://hongcam.com.cn/product/product-detail.asp?id=271
COSMO-RS用于计算流体的热力学性质,包括:
● 活度系数,溶剂化自由能,亨利常数
● 溶解度
● 分配系数(logP)
● (部分)蒸汽压
● 溶液沸点
● 气-液与液-液二元混合(VLE/LLE)
● 估计HE、GE
● pKa值
● Sigma profiles与Sigma potential

图18 亨利常数实验值与计算值对比
COSMO-RS计算基于Klamt的工作,并使用ADF Slater基组拟合出参数。与其他过度经验参数化的方法如UNIFAC不同,COSMO-RS以量子化学计算产生的结果为基础,因此其结果与UNIFAC相比具有更强的预测能力。COSMO-RS目前包含1800多种常用化合物,但用户可以轻松地通过ADF自建需要的其他化合物,用于COSMO-RS计算(详见COSMO-RS指南)。
另外,COSMOtherm也行,详细的我就不多说了,具体的请参看http://www.tech-box.com.cn/cosmotherm.html

[ Last edited by gongyiweimu on 2012-7-12 at 19:31 ]

上面宏剑的网址确实不能打开,这个是新的http://www.hongcam.com.cn/index.php/product/platform/adf,你也可以到宏剑主页找ADF的介绍。

[ Last edited by gongyiweimu on 2012-11-20 at 17:00 ]
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远山飘渺或可登
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gongyiweimu

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by Siriusgoul at 2012-07-08 20:31:27
嗯,新人坐等高手解答……
我在想,这个东西传统的量化计算怕不好说明问题,应该是用分子动力学模拟好点吧,看看底下怎么说……

嗯,欢迎讨论。不过纯分子动力学的模拟,准确性不够吧?
远山飘渺或可登
5楼2012-07-09 11:06:29
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Siriusgoul

铜虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
嗯,新人坐等高手解答……
我在想,这个东西传统的量化计算怕不好说明问题,应该是用分子动力学模拟好点吧,看看底下怎么说……
2楼2012-07-08 20:31:27
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agent99

禁虫 (正式写手)

物化程序猿


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
同意LS,应该要用到分子动力学,而且还要是显式溶剂,计算量会很大
理论与计算化学,化学物理,生物物理
3楼2012-07-08 21:12:44
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gongyiweimu

木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by agent99 at 2012-07-08 21:12:44
同意LS,应该要用到分子动力学,而且还要是显式溶剂,计算量会很大

昨晚想了一想,用量化的方法可能不现实,感觉应该用分子动力学方法可以。个人认为应用QM/MM吧,纯分子动力学方法太粗糙了。欢迎大家一起讨论。
远山飘渺或可登
4楼2012-07-09 11:04:53
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