应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » QE(Pwscf) » TiO2优化
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 968  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

yanglina062

银虫 (小有名气)

[求助] TiO2优化

哪位高手帮我解决一下这个问题吧，不胜感激！用QUANTUM espresso 优化TiO2，不管如何调整构型，总是出现同样的错误，输入输出文件如下：
输入文件：
&CONTROL
  calculation  = 'relax',
  prefix       = 'tio2-opt',
  pseudo_dir   = '/home/yanglina/espresso-4.3.2/pseudo-new',
  outdir       = '/scratch/yanglina/',
  nstep        = 300
  forc_conv_thr= 1.0D-3
  tprnfor      = .TRUE
  etot_conv_thr= 1.0D-4
/
&SYSTEM
  ibrav     = 6,
  celldm(1) = 66.1404,
  celldm(3) = 1.7143,
  nat       = 114,
  ntyp      = 2,
  ecutwfc   = 50.D0,
  ecutrho   = 400.D0,
/
&ELECTRONS
  conv_thr    = 1.D-7,
  mixing_beta = 0.7D0,
/
&EE
  which_compensation='martyna-tuckerman'
/
&IONS
/
ATOMIC_SPECIES      
       O     15.9989995956  O.pbe-van_ak.UPF
      Ti     47.9000015259  Ti.pbe-sp-van_ak.UPF
ATOMIC_POSITIONS {crystal}
  O   0.4631929382140079   0.2905623975498066   0.5324242920696773
  O   0.4238015295661982   0.2905623975498066   0.4734759659588378
  O   0.3991900973544585   0.3449052532757761   0.5471693049887855
  O   0.3577843786872920   0.3992481090017457   0.5226926496644853
  O   0.4631929382140079   0.3992481090017457   0.5324242920696773
  O   0.4217872331707601   0.3449052532757762   0.5079476367453772
  O   0.4660986748647473   0.3449052532757762   0.4637326251486978
  O   0.4238015295661982   0.3992481090017457   0.4734759659588378
  O   0.3577843786872920   0.5079338340776037   0.5226926496644853
  O   0.4631929382140079   0.5079338340776036   0.5324242920696772
  O   0.3597986614588112   0.4535909647277153   0.4882109652976235
  O   0.4217872331707601   0.4535909647277154   0.5079476367453772
  O   0.4660986748647473   0.4535909647277154   0.4637326251486978
  O   0.4238015295661982   0.5079338340776036   0.4734759659588378
  O   0.3991900973544585   0.5622766761796547   0.5471693049887855
  O   0.3577843786872920   0.6166195455295433   0.5226926496644853
  O   0.4631929382140079   0.6166195455295433   0.5324242920696772
  O   0.3597986614588112   0.5622766761796547   0.4882109652976235
  O   0.4217872331707601   0.5622766761796547   0.5079476367453772
  O   0.4660986748647473   0.5622766761796548   0.4637326251486978
  O   0.4238015295661982   0.6166195455295433   0.4734759659588378
  O   0.3991900973544585   0.6709623876315939   0.5471693049887855
  O   0.3597986614588112   0.6709623876315939   0.4882109652976235
  O   0.4217872331707601   0.6709623876315939   0.5079476367453772
  O   0.4660986748647473   0.6709623876315939   0.4637326251486978
  O   0.5468929547806932   0.2905623975498066   0.5471693049887855
  O   0.6531900935397614   0.2905623975498066   0.5226926496644853
  O   0.5075015188850457   0.2905623975498066   0.4882109652976235
  O   0.5694901042209138   0.2905623975498066   0.5079476367453772
  O   0.6138015186670633   0.2905623975498066   0.4637326251486978
  O   0.5301015293482156   0.2905623975498066   0.4489976258099120
  O   0.5063358018963462   0.3490624013645038   0.5227159828960933
  O   0.6531900935397614   0.3992481090017457   0.5226926496644853
  O   0.6108958092641615   0.3449052532757762   0.5324242920696772
  O   0.6552043626873619   0.3449052532757762   0.4882109652976235
  O   0.5075015188850457   0.3992481090017457   0.4882109652976235
  O   0.7171929752710673   0.3449052532757762   0.5079476367453772
  O   0.5694901042209138   0.3992481090017457   0.5079476367453772
  O   0.6138015186670633   0.3992481090017457   0.4637326251486978
  O   0.5715043733685142   0.3449052532757762   0.4734759659588378
  O   0.7192072444186678   0.3992481090017457   0.4734759659588378
  O   0.6778043731505317   0.3449052532757762   0.4489976258099120
  O   0.5301015293482156   0.3992481090017457   0.4489976258099120
  O   0.5468929547806932   0.5079338340776036   0.5471693049887855
  O   0.5055500832509778   0.4578424039584980   0.5222476334393061
  O   0.6531900935397614   0.5079338340776037   0.5226926496644853
  O   0.6108958092641615   0.4535909647277154   0.5324242920696772
  O   0.6552043626873619   0.4535909647277154   0.4882109652976235
  O   0.5075015188850457   0.5079338340776036   0.4882109652976235
  O   0.7171929752710673   0.4535909647277154   0.5079476367453772
  O   0.5694901042209138   0.5079338340776036   0.5079476367453772
  O   0.6138015186670633   0.5079338340776037   0.4637326251486978
  O   0.5715043733685142   0.4535909647277154   0.4734759659588378
  O   0.7192072444186678   0.5079338340776037   0.4734759659588378
  O   0.6778043731505317   0.4535909647277154   0.4489976258099120
  O   0.5468929547806932   0.6166195455295433   0.5471693049887855
  O   0.5054872224896079   0.5622766761796548   0.5226926496644853
  O   0.6531900935397614   0.6166195455295433   0.5226926496644853
  O   0.6108958092641615   0.5622766761796548   0.5324242920696772
  O   0.6552043626873619   0.5622766761796548   0.4882109652976235
  O   0.5075015188850457   0.6166195455295433   0.4882109652976235
  O   0.7171929752710673   0.5622766761796548   0.5079476367453772
  O   0.5694901042209138   0.6166195455295433   0.5079476367453772
  O   0.6138015186670633   0.6166195455295433   0.4637326251486978
  O   0.5715043733685142   0.5622766761796548   0.4734759659588378
  O   0.7192072444186678   0.6166195455295433   0.4734759659588378
  O   0.5301015293482156   0.6166195455295433   0.4489976258099120
  O   0.5054872224896079   0.6709623876315939   0.5226926496644853
  O   0.6108958092641615   0.6709623876315940   0.5324242920696772
  O   0.6552043626873619   0.6709623876315938   0.4882109652976235
  O   0.7171929752710673   0.6709623876315939   0.5079476367453772
  O   0.5715043733685142   0.6709623876315940   0.4734759659588378
  O   0.6778043731505317   0.6709623876315939   0.4489976258099120
  O   0.3594100936705509   0.3456423958386424   0.4865026484946451
  O   0.5484786699383385   0.4026766907844955   0.5465642940024573
  O   0.5315443840932631   0.5075909745369369   0.4485159567018391
Ti   0.3686386637912261   0.3449052532757761   0.5201909711976883
Ti   0.4523386531100738   0.3449052532757762   0.5349259705364742
Ti   0.3686386637912261   0.4535909647277153   0.5201909711976883
Ti   0.4129501054852133   0.4535909647277154   0.4759759596010090
Ti   0.3686386637912261   0.5622766761796547   0.5201909711976883
Ti   0.4523386531100738   0.5622766761796547   0.5349259705364742
Ti   0.4129501054852133   0.5622766761796547   0.4759759596010090
Ti   0.3686386637912261   0.6709623876315939   0.5201909711976883
Ti   0.4523386531100738   0.6709623876315939   0.5349259705364742
Ti   0.4129501054852133   0.6709623876315939   0.4759759596010090
Ti   0.5163415075935420   0.2905623975498066   0.5201909711976883
Ti   0.6000415241602274   0.2905623975498066   0.5349259705364742
Ti   0.4769529599686815   0.2905623975498066   0.4612309784710448
Ti   0.5606529492875293   0.2905623975498066   0.4759759596010090
Ti   0.6640443786436956   0.3449052532757762   0.5201909711976883
Ti   0.6000415241602274   0.3992481090017457   0.5349259705364742
Ti   0.6246558037709975   0.3449052532757762   0.4612309784710448
Ti   0.4769529599686815   0.3992481090017457   0.4612309784710448
Ti   0.7083557930898452   0.3449052532757762   0.4759759596010090
Ti   0.5606529492875293   0.3992481090017457   0.4759759596010090
Ti   0.6640443786436956   0.4535909647277154   0.5201909711976883
Ti   0.5172615308304979   0.5112509585806032   0.5200176249961096
Ti   0.6000415241602274   0.5079338340776037   0.5349259705364742
Ti   0.6246558037709975   0.4535909647277154   0.4612309784710448
Ti   0.4769529599686815   0.5079338340776036   0.4612309784710448
Ti   0.7083557930898452   0.4535909647277154   0.4759759596010090
Ti   0.6640443786436956   0.5622766761796548   0.5201909711976883
Ti   0.5163415075935420   0.6166195455295433   0.5201909711976883
Ti   0.6000415241602274   0.6166195455295433   0.5349259705364742
Ti   0.4769529599686815   0.6166195455295433   0.4612309784710448
Ti   0.7083557930898452   0.5622766761796548   0.4759759596010090
Ti   0.5606529492875293   0.6166195455295433   0.4759759596010090
Ti   0.6640443786436956   0.6709623876315938   0.5201909711976883
Ti   0.6246558037709975   0.6709623876315938   0.4612309784710448
Ti   0.7083557930898452   0.6709623876315939   0.4759759596010090
Ti   0.4108243654339437   0.3455795418892318   0.4733992905437988
Ti   0.5159815091630173   0.4032795355677334   0.5204842896282710
Ti   0.5634472422824373   0.5067395341072493   0.4749509822348795
K_POINTS {Gamma}
   输出文件：
number of k points=     1
                       cart. coord. in units 2pi/alat
        k(    1) = (   0.0000000   0.0000000   0.0000000), wk =   2.0000000

     Dense  grid: 33504281 G-vectors     FFT dimensions: ( 432, 432, 729)

     Smooth grid: 11845518 G-vectors     FFT dimensions: ( 300, 300, 512)

     Largest allocated arrays     est. size (Mb)     dimensions
        Kohn-Sham Wavefunctions      1717.27 Mb     ( 246805,  456)
        NL pseudopotentials          4865.60 Mb     ( 246805, 1292)
        Each V/rho on FFT grid        347.41 Mb     (*******)
        Each G-vector array            42.60 Mb     (5584044)
        G-vector shells                13.39 Mb     (1754943)
     Largest temporary arrays     est. size (Mb)     dimensions
        Auxiliary wavefunctions      3434.54 Mb     ( 246805, 1824)
        Each subspace H/S matrix       25.38 Mb     (1824,1824)
        Each matrix      4.49 Mb     (   1292,  456)
        Arrays for rho mixing       -1316.69 Mb     (*******,   8)

     Initial potential from superposition of free atoms
     Check: negative starting charge=   -0.868254

     starting charge  873.99821, renormalised to  912.00000

     negative rho (up, down):  0.906E+00 0.000E+00
     Starting wfc are  684 atomic wfcs
rank 0 in job 1  c12_45510   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 0: killed by signal 9
回复此楼

» 猜你喜欢
come on!
1楼 2012-07-06 16:01:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

frank_zhan

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
yanglina062: 金币+3, ★★★很有帮助, 谢谢指点，作业交到胖节点已经正常计算了！ 2012-07-11 10:44:22
我觉得内存不够是最有可能的。建议可以第一将celldm(3)减小一些，同时将ecutwfc减小一些。
赞一下 回复此楼
frank_zhan,zy2zhan@gmail.com
4楼2012-07-07 14:47:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

souledge

专家顾问 (著名写手)
★ ★
xueht987: 金币+2, 专家考核, 多谢指教！ 2012-07-07 12:31:03
没有详细的报错信息，个人猜测（仅仅是猜测），一是可能编译的版本有问题，容易产生计算错误，建议先用小体系尝试一下～二是内存严重不足，LZ的体系非常大，并且对称性低，需要的内存很多～至于
CODE:
&EE
  which_compensation='martyna-tuckerman'

这一段～这是老版本支持的参数吧～现在是直接在&system中assume_isolated中……不过这个不会是出错的理由～
赞一下 回复此楼
思想重于技巧，内涵重于表象
2楼2012-07-06 16:41:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yanglina062

银虫 (小有名气)
???????:
2?: Originally posted by souledge at 2012-07-06 16:41:49
??????????????????????????????????????????汾???????????????????????????С?????????????????????????LZ?????????????????????????????????
&EE
  which_ ...

您好，这个软件我刚接触，我是先用它算的苯环的相关性质，正常结???了的。您说我这个内存严????足，那我在命令部分哪儿???以定义内存呢？是??是得???几个GB了？谢谢啦??
赞一下 回复此楼
come on!
3楼2012-07-07 10:34:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 288求调剂 一志愿哈工大 材料与化工 +11 洛神哥哥 2026-04-03 11/550 2026-04-04 06:08 by xuxiang
[考研] 调剂 +6 19945159693 2026-04-03 7/350 2026-04-03 22:04 by 啵啵啵0119
[考研] 材料334求调剂 +9 Eecho# 2026-04-03 9/450 2026-04-03 21:38 by lbsjt
[考研] 学硕288调剂!!! +3 小王xw123 2026-04-03 3/150 2026-04-03 21:20 by 啵啵啵0119
[考研] 336求调剂 +8 kiyy 2026-04-01 8/400 2026-04-03 19:41 by lijunpoly
[考研] 329求调剂 +9 miaodesi 2026-04-02 11/550 2026-04-03 18:28 by ls刘帅
[考研] 求调剂 +4 15064154688 2026-04-03 5/250 2026-04-03 15:07 by zrongyan
[考研] 289-求调剂 +4 这里是_ 2026-04-03 4/200 2026-04-03 14:23 by 1753564080
[考研] 085600，材料与化工321分求调剂 +12 大馋小子 2026-03-28 12/600 2026-04-03 14:16 by 百灵童888
[考研] 求调剂 +3 晟功? 2026-04-03 3/150 2026-04-03 11:52 by wxiongid
[考研] 085600 295分求调剂 +19 W55j 2026-03-30 23/1150 2026-04-03 09:53 by 千千运气
[考研] 一志愿安徽大学0817化学工程与技术，求调剂 +14 我不是只因 2026-04-02 15/750 2026-04-03 09:49 by 蓝云思雨
[考研] 294求调剂 +3 Grey_Ey 2026-04-02 5/250 2026-04-02 21:34 by swb0218
[考研] 材料科学与工程调剂 +18 深V宿舍吧 2026-03-30 19/950 2026-04-02 10:28 by sanrepian
[考研] 化学工程专硕324分，一志愿中国矿业大学求调剂 +7 耿耿1314 2026-04-01 7/350 2026-04-02 07:40 by 尚水阁主
[考研] 材料调剂 +11 一样YWY 2026-03-31 11/550 2026-04-01 22:25 by zhouyuwinner
[考研] 296求调剂 +4 汪！？！ 2026-03-31 7/350 2026-04-01 22:04 by 客尔美德
[考研] 349求调剂 +6 吃的不少 2026-04-01 6/300 2026-04-01 17:55 by JYD2011
[考研] 283求调剂 +9 A child 2026-03-28 9/450 2026-04-01 14:20 by Jaylen.
[考研] 323分 食品与营养调剂 +3 嘿ooo 2026-03-31 3/150 2026-03-31 09:38 by longlotian
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭