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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » 已经知道PDF卡片号，如何获取晶体原始的cif文件
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kaixinxixi

新虫 (正式写手)

[求助] 已经知道PDF卡片号，如何获取晶体原始的cif文件

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1楼 2012-06-26 22:49:48
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gyliu

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
huangjr: 金币+1, 感谢应助~ 2012-06-27 14:55:43
kaixinxixi: 金币+1, ★有帮助 2012-06-28 08:28:25
根据卡片号的情况，如果卡片号是70卷或70卷以上，那就从卡片里找到ICSD的代码，然后在ICSD数据里直接找就可以了。如果卡片不是从ICSD数据计算来的，你就根据卡片上的晶体学信息查文献或者看看ICSD里能否找到。
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2楼2012-06-27 12:34:10
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gyliu

铁杆木虫 (职业作家)
★
huangjr: 金币+1, 感谢热心帮助~ 2012-06-30 09:56:11
*data for   ICSD #9828
Coll Code   9828
Rec  Date   1980/01/01
Mod  Date   1997/11/10
Chem Name   Calcium Barium Magnesium Manganese Silicate *
Structured  Ca13.5 Ba.3 Mg1.8 Mn.4 Si9 O32
Sum         Ba0.3 Ca13.5 Mg1.8 Mn0.4 O32 Si9
ANX         AB4C7X16
Min Name    Bredigite
D(calc)     3.48
Title       The crystal strucutre of Bredigite and the genealogy of some alkaline
            earth orthosilicates
Author(s)   Moore, P.B.;Araki, T.
Reference   American Mineralogist
            (1976), 61, 74-87
Unit Cell   10.909(9) 18.34(1) 6.739(9) 90. 90. 90.
Vol         1348.28
Z           2
Space Group P 2 n n
SG Number   34
Cryst Sys   orthorhombic
Pearson     oP112
Wyckoff     c26 b2 a2
R Value     .108
Red Cell    P  6.739 10.909 18.34 90 90 90 1348.279
Trans Red   0.000 0.000 1.000 / 1.000 0.000 0.000 / 0.000 1.000 0.000
Comments    Compound with mineral name: Bredigite
            The structure has been assigned a PDF number (calculated
            powder diffraction data): 01-071-1149
            The structure has been assigned a PDF number (experimental
            powder diffraction data): 35-260
            X-ray diffraction from single crystal
            Difference between the formula calculated from the PARM
            record and the FORM record tolerable.
            At least one temperature factor is implausible or
            meaningless but agrees with the value given in the paper.
Atom  #   OX   SITE      x           y           z           SOF      H        ITF(B)   
Ca   1  +2    2 a   0           0           0              0.707(6)   0               0
Ca   2  +2    2 a   0.5016(11)  0           0              1.         0               0
Ca   3  +2    4 c   0.2362(6)   0.2284(2)   -.0003(4)      1.         0               0
Ca   4  +2    4 c   0.7728(6)   0.2272(7)   0.0056(4)      1.         0               0
Ca   5  +2    4 c   0.2564(7)   0.4103(2)   0.1540(4)      0.88(3)    0               0
Ca   6  +2    4 c   0.7556(7)   0.4119(2)   0.1614(4)      1.         0               0
Ca   7  +2    4 c   0.0081(8)   0.1722(1)   0.3310(2)      1.         0               0
Ca   8  +2    4 c   0.5061(7)   0.1654(1)   0.3008(19)     1.         0               0
Ba   1  +2    2 a   0           0           0              0.293(6)   0               0
Mg   1  +2    2 b   -.0003(9)   0.5         0              0.64(1)    0               0
Mg   2  +2    2 b   0.5002(12)  0.5         0              0.93(1)    0               0
Mg   3  +2    4 c   0.2564(7)   0.4103(2)   0.1540(4)      0.12(3)    0               0
Mn   1  +2    2 b   -.0003(9)   0.5         0              0.36(1)    0               0
Mn   2  +2    2 b   0.5002(12)  0.5         0              0.07(1)    0               0
Si   1  +4    4 c   0.7542(8)   0.0811(3)   0.2188(5)      1.         0          1.0(1)
Si   2  +4    4 c   0.2594(8)   0.0798(2)   0.2199(5)      1.         0          0.7(1)
Si   3  +4    4 c   0.0037(9)   0.1649(1)   -.2341(3)      1.         0          0.8(1)
Si   4  +4    4 c   0.0043(8)   0.3364(1)   0.2831(3)      1.         0          0.8(1)
O    1  -2    4 c   0.6388(15)  0.0259(8)   0.2695(18)     1.         0          2.4(3)
O    2  -2    4 c   0.8681(11)  0.0495(6)   0.3444(14)     1.         0          1.5(2)
O    3  -2    4 c   0.7196(12)  0.1605(7)   0.3054(16)     1.         0          1.1(2)
O    4  -2    4 c   0.7885(15)  0.0883(8)   -.0081(19)     1.         0          2.1(3)
O    5  -2    4 c   0.1285(13)  0.0609(7)   0.3311(16)     1.         0          2.2(2)
O    6  -2    4 c   0.3626(11)  0.0241(6)   0.2900(14)     1.         0          0.9(2)
O    7  -2    4 c   0.2923(13)  0.1592(8)   0.3233(18)     1.         0          1.7(2)
O    8  -2    4 c   0.2294(13)  0.0913(7)   -.0103(16)     1.         0          1.1(2)
O    9  -2    4 c   -.113(2)    0.1991(11)  -.3463(26)     1.         0          4.6(4)
O    10 -2    4 c   0.1249(11)  0.1985(6)   -.3393(11)     1.         0          0.3(1)
O    11 -2    4 c   -.0042(17)  0.0796(4)   -.2794(9)      1.         0          2.1(1)
O    12 -2    4 c   0.0057(23)  0.1912(4)   -.011(1)       1.         0          2.2(2)
O    13 -2    4 c   -.1219(11)  0.2900(6)   0.2500(11)     1.         0          0.6(1)
O    14 -2    4 c   0.1198(14)  0.2850(7)   0.2699(15)     1.         0          2.0(2)
O    15 -2    4 c   0.0127(14)  0.3969(3)   0.1015(8)      1.         0          1.3(1)
O    16 -2    4 c   -.0006(17)  0.3760(3)   0.4934(8)      1.         0          1.2(1)
Lbl  Type   Beta11      Beta22      Beta33      Beta12      Beta13      Beta23
Ca1  Ca2+  0.00488(19) 0.00123(6)  0.00502(26) 0           0           0.00068(9)  
Ca2  Ca2+  0.00537(29) 0.00064(7)  0.00518(36) 0           0           -.00031(15)
Ca3  Ca2+  0.00147(27) 0.00049(8)  0.00412(44) 0.00040(14) -.00030(26) -.00027(14)
Ca4  Ca2+  0.00181(30) 0.0010(1)   0.00527(47) 0.00010(15) -.00085(29) 0.00000(16)
Ca5  Ca2+  0.00272(31) 0.00107(11) 0.00650(59) -.00041(17) -.00021(42) 0.00093(17)
Ca6  Ca2+  0.00298(26) 0.00067(9)  0.00334(43) -.00073(14) -.00138(35) -.00074(14)
Ca7  Ca2+  0.00308(18) 0.00092(6)  0.00584(29) -.00052(19) 0.0002(5)   -.00004(10)
Ca8  Ca2+  0.00213(17) 0.00162(6)  0.00553(28) -.00069(21) 0.0009(5)   0.00039(11)
Ba1  Ba2+  0.00488(19) 0.00123(6)  0.00502(26) 0           0           0.00068(9)  
Mg1  Mg2+  0.00124(30) 0.00059(9)  0.00456(48) 0           0           0.00030(17)
Mg2  Mg2+  0.00075(36) 0.00036(11) 0.00228(59) 0           0           -.00007(20)
Mg3  Mg2+  0.00272(31) 0.00107(11) 0.00650(59) -.00041(7)  -.00021(42) 0.00093(17)
Mn1  Mn2+  0.00124(30) 0.00059(9)  0.00456(48) 0           0           0.00030(17)
Mn2  Mn2+  0.00075(36) 0.00036(11) 0.00228(59) 0           0           -.00007(20)
*end for    ICSD #9828
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8楼2012-06-29 17:56:57
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kaixinxixi

新虫 (正式写手)
引用回帖:
14楼: Originally posted by lqingh506 at 2012-07-02 08:23:00
先随便下一个cif文件，右键文本格式打开，把上述内容复制粘贴过去保存就可以的，祝好！...

这么聪明！额怎么就想不到啊。谢谢诶！！！
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15楼2012-07-02 13:56:25
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普通回帖

kaixinxixi

新虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gyliu at 2012-06-27 12:34:10
根据卡片号的情况，如果卡片号是70卷或70卷以上，那就从卡片里找到ICSD的代码，然后在ICSD数据里直接找就可以了。如果卡片不是从ICSD数据计算来的，你就根据卡片上的晶体学信息查文献或者看看ICSD里能否找到。

我其实已经到ICSD网站上去了，可是我输入信息后，显示不出来。我知道物质的JCPDS号，我想知道结构，可是怎么也查不到，原始文献也找不到。很苦恼。是不是ICSD需要注册什么的啊？
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3楼2012-06-28 08:28:14
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gyliu

铁杆木虫 (职业作家)
卡片号是多少？我帮你试试
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4楼2012-06-28 12:29:14
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kaixinxixi

新虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by gyliu at 2012-06-28 12:29:14
卡片号是多少？我帮你试试

JCPDS号是360399，化学式是Ca14Mg2（SiO4）8或者JCPDS号是271060，化学式是Ca7Mg（SiO4）4也行啊，非常谢谢诶啊。
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5楼2012-06-29 10:59:47
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gyliu

铁杆木虫 (职业作家)
★
huangjr: 金币+1, 感谢热心回帖~ 2012-06-30 09:57:02
NOTE:  Solutions of calcium and magnesium nitrates and colloidal silica were mixed, dried and fired at 600 C for 24 hours, pelletized and fired at 1200 C for 21 hours. To replace 00-014-0012 and 00-035-0260. Optical data on synthetic Ca2 Si O4. The $GAL' phase of dicalcium silicate. See ICSD 9828 (PDF 01-071-1149).
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6楼2012-06-29 17:53:57
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gyliu

铁杆木虫 (职业作家)
上面是360399的说明，但是71-1149和36-0399的空间群不一样。
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7楼2012-06-29 17:56:09
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kaixinxixi

新虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by gyliu at 2012-06-29 17:56:57
*data for   ICSD #9828
Coll Code   9828
Rec  Date   1980/01/01
Mod  Date   1997/11/10
Chem Name   Calcium Barium Magnesium Manganese Silicate *
Structured  Ca13.5 Ba.3 Mg1.8 Mn.4 Si9 O32
Sum    ...

,很感谢啊，不过怎么才能把你给我的上述信息改写成cif文件那，只有手动输入Diamond中吗？刚开始接触，很多不懂的东西。再有问你个问题啊，你在ISCD网站求过化合物的结构数据吗？
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9楼2012-06-29 19:59:14
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kaixinxixi

新虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by gyliu at 2012-06-29 17:56:09
上面是360399的说明，但是71-1149和36-0399的空间群不一样。

我对结构不太懂，我感觉也应该不一样，但是他俩的出峰位置很相似啊。你是怎么知道他们结构不一样的啊？单凭不一样的卡片号吗？麻烦啊，我的金币不多，不好意思。没法有偿报酬啊。嘿嘿
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10楼2012-06-29 20:01:00
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