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求助！gauss03中BSSE校正的问题
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求助！gauss03中BSSE校正的问题 我想计算α-硝基萘和TNT之间能否形成氢键，通过MP2/6-311++G(d，p)分别计算了α-硝基萘的单点能和TNT 的单点能以及两个分子在一起的单点能。再通过ΔE=E（AB）-E(A)-E(B)得到能量差。可是这个能量差不准确，必须通过BSSE方法校正，可是为什么我用BSSE总是出错啊！ 如图所示： 我的输入命令是：%Section %Chk=Untitled-3.chk Route Section # RMP2(FC)/6-311++G(d,p) Opt counterpoise=2 Title Section Untitled-3 Charge, Multipl. 0 1 Molecule Specification 6 0 4.560338 1.618156 -0.089617 6 0 5.815798 2.128637 0.006929 6 0 6.947036 1.283478 0.066041 6 0 6.784170 -0.061692 0.015170 6 0 5.489676 -0.633954 -0.095308 6 0 4.358101 0.211032 -0.138311 6 0 5.329559 -2.042418 -0.168744 6 0 4.104053 -2.609191 -0.302790 6 0 2.960555 -1.788481 -0.370841 6 0 3.095672 -0.440260 -0.278208 7 0 1.851536 0.318887 -0.307856 8 0 0.979426 -0.076342 -1.027925 8 0 1.745112 1.272264 0.401756 1 0 3.720588 2.279786 -0.122468 1 0 5.950383 3.194907 0.041058 1 0 7.929867 1.711497 0.147559 1 0 7.635528 -0.718198 0.052724 1 0 6.208541 -2.660664 -0.119206 1 0 3.990983 -3.675860 -0.356456 1 0 1.984077 -2.219849 -0.470608 6 0 -4.393816 -0.268290 -0.114353 6 0 -4.165297 1.091910 -0.154956 6 0 -2.899300 1.551491 0.125910 6 0 -1.867735 0.685845 0.416007 6 0 -2.138816 -0.667592 0.390910 6 0 -3.398543 -1.216266 0.133778 7 0 -2.651605 2.986795 0.118065 8 0 -1.554001 3.353102 0.393576 8 0 -3.570078 3.695433 -0.161413 7 0 -5.787655 -0.652856 -0.348590 8 0 -6.281296 -1.450078 0.387876 8 0 -6.349490 -0.101933 -1.242956 7 0 -0.993158 -1.534300 0.664498 8 0 -0.866756 -2.522888 0.010059 8 0 -0.246588 -1.182288 1.523525 6 0 -3.636555 -2.710756 0.091020 1 0 -4.957460 1.773358 -0.387866 1 0 -0.880207 1.047595 0.619990 1 0 -3.165340 -3.118989 -0.792426 1 0 -4.685152 -2.941190 0.083654 1 0 -3.185643 -3.190125 0.949416 如果不对，谁能告诉我BSSE的输入命令怎么输啊！！请尽量说详细点！！是不是跟Charge, Multipl有关？多谢啊！   |
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一、电荷和多重度那一行，需要输入总体系电荷和多重度，片段一的电荷和多重度，片段二的电荷和多重度。都是使用空格隔开 二、在描述分子坐标的时候，每个原子结尾空格再加上数字1 或2,3.。。。n，n为你的总分子个数，表示该原子属于第一个分子或第n个分子。 三、内存可能不够，你可以适当增大。。 贴上一点我的为例： %chk=MS-W_c0.chk %nprocshared=2 %mem=300MW # opt freq rb3lyp/6-31+g(d) geom=connectivity counterpoise=2 pop=chelpg **** -1 1 -1 1 0 1 S 2.65937359 -1.23767582 -0.88834234 1 O 4.12948866 -1.40064075 -0.84694120 1 O 2.24316655 -0.78869888 0.71240327 1 O 1.88679986 -2.47813609 -1.03903157 1 O 2.20454403 -0.09649792 -1.71319569 1 C 2.84981075 0.40988686 1.16713828 1 H 2.49748609 0.56773312 2.19070079 1 H 3.94320578 0.32569657 1.16704610 1 H 2.55616883 1.26377557 0.54485489 1 O 0.60081140 -2.82173918 1.56529076 2 H 0.89189018 -3.05353929 0.67820546 2 H 1.06612163 -2.00659723 1.77602391 2 1 2 2.0 3 1.0 4 2.0 5 2.0 2 3 6 1.0 4 5 6 7 1.0 8 1.0 9 1.0 7 8 9 10 11 1.0 12 1.0 11 12 之前老是在木虫上找解i决问题的方法，第一次应助希望能帮到你 |
5楼2012-06-23 12:11:57
2楼2012-06-22 17:01:42
3楼2012-06-22 22:51:46
finesun
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
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- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
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很简单，如 甲醇+水，gjf文件如下： %chk=1.chk %mem=12mw # MP2/6-311++G(d,p) Opt counterpoise=2 Title Card Required 0 1 C -2.23131677 1.63583155 0.20830109 1 H -1.87466234 0.62702155 0.20830109 1 H -1.87464393 2.14022974 -0.66535042 1 H -3.30131677 1.63584473 0.20830109 1 O -1.75464185 2.30993380 1.37589142 1 H -2.07440054 3.21511567 1.37630755 1 O -2.03197324 4.67082275 1.66933740 2 H -1.57666283 4.95221274 2.46627661 2 H -2.59015021 5.38381576 1.35046526 2 |
4楼2012-06-23 10:46:36
