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西交-flx

新虫 (初入文坛)

[求助] 质粒提取~

请教各位大侠:
     本人提取质粒,载体是pEGFP-N1,用质粒小提试剂盒分别提取了两次菌液,跑胶显示什么都没提取出来,后改用质粒小提中量试剂盒,跑电泳提取出来了,想问问是什么原因?这两种试剂盒有什么不同,是纯化柱的原因吗?若能帮助小女不胜感激~~~
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keydy

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, 鼓励热心的虫虫 2012-06-22 13:37:41
西交-flx: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2012-06-25 08:46:13
“小提试剂盒”和“小提中量试剂盒”的差别在于一次抽提量的多少。
我想你应该使用的是离心柱型的kit,而抽提的pEGFP-N1本身拷贝数不算低,因此,如果平行试验的话,应该都能抽提出质粒。
由于你提供的信息太少,我分析你可能在使用小提试剂盒的时候哪个环节没有处理好,甚至是培养菌液的时候就有问题。
2楼2012-06-22 10:32:58
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jimjohntall

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
应该不是纯化柱的问题,可能是你其他操作问题,有可能是你做质粒小提时,菌液太多裂解不完全造成的
3楼2012-06-22 10:58:29
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504775490

金虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
应该不是柱子的问题吧,这两种试剂盒只是对于提取质粒的量不同罢了,是不是哪个步骤搞错了哦!
4楼2012-06-22 11:14:27
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flownaway

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
试剂盒应该是不会出问题的,可能是操作失误吧...
5楼2012-06-22 15:16:55
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西交-flx

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by keydy at 2012-06-22 10:32:58
“小提试剂盒”和“小提中量试剂盒”的差别在于一次抽提量的多少。
我想你应该使用的是离心柱型的kit,而抽提的pEGFP-N1本身拷贝数不算低,因此,如果平行试验的话,应该都能抽提出质粒。
由于你提供的信息太少,我 ...

的确,菌液量不同,前两次用小提试剂盒时菌液量比较少,比较难于抽提。。。
6楼2012-06-25 08:47:54
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西交-flx

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by jimjohntall at 2012-06-22 10:58:29
应该不是纯化柱的问题,可能是你其他操作问题,有可能是你做质粒小提时,菌液太多裂解不完全造成的

前两次菌液量太少,很难抽提出质粒。。。
7楼2012-06-25 08:48:52
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西交-flx

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 504775490 at 2012-06-22 11:14:27
应该不是柱子的问题吧,这两种试剂盒只是对于提取质粒的量不同罢了,是不是哪个步骤搞错了哦!

是的,现在搞明白了,是菌液量太少造成的,谢谢您的回复!
8楼2012-06-25 08:49:35
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西交-flx

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by flownaway at 2012-06-22 15:16:55
试剂盒应该是不会出问题的,可能是操作失误吧...

前两次菌液量太少造成的~试剂盒没问题的。。。 谢谢回复!
9楼2012-06-25 08:50:42
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西交-flx

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by keydy at 2012-06-22 10:32:58
“小提试剂盒”和“小提中量试剂盒”的差别在于一次抽提量的多少。
我想你应该使用的是离心柱型的kit,而抽提的pEGFP-N1本身拷贝数不算低,因此,如果平行试验的话,应该都能抽提出质粒。
由于你提供的信息太少,我 ...

还有一点,当时用小提试剂盒时菌液量比较少,质粒提取后跑胶什么条带都没有;后来菌液量培养大时用小提中量试剂盒提取出来了所谓质粒,但是跑胶显示条带很浅,而且质粒理论上应该跑出三个条带,但是我这个跑出了五六个条带,条带间距离挨得很近,后来把菌液送去测序结果说是没有抽提出质粒,也就是之前我提取的就不是质粒,搞不清楚是什么。。。现在还不知道原因是什么?能否帮我分析分析。。。
10楼2012-06-25 09:01:01
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