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flymice

金虫 (著名写手)

[求助] 求问什么是internal rotational angle?

如题,小弟不是化学类的,最近建构高分子模型看到了这个词,但是使用百度和google都没能找到它的定义,希望能有高手给我解释一下这个角度的定义。
如果能够给出实例更加好。
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Believeinyourself,impossibleisnothing.
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softman606

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by softman606 at 2012-06-19 16:52:08
高分子物理中提到的“内旋角”。你需要理解“键角”“构象”“链段”这些词。说白了就是碳-碳原子之间有个角度(原子并非都是直线排列),而且时刻在变。分子链运动时,第2个原子会以第1个原子为支点,键角为角度进 ...

我想到了三节棍。耍的时候像极了分子链运动,棍转动的角度就是棍的内旋角。
4楼2012-06-19 16:56:37
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wwxuan1983

木虫 (正式写手)

工程师

你最好能给出一段话
2楼2012-06-19 15:19:51
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softman606

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
flymice: 金币+5, 有帮助, 多谢了,但是还是有点不明白。实例在回复中,麻烦您看一下。 2012-06-20 13:37:03
高分子物理中提到的“内旋角”。你需要理解“键角”“构象”“链段”这些词。说白了就是碳-碳原子之间有个角度(原子并非都是直线排列),而且时刻在变。分子链运动时,第2个原子会以第1个原子为支点,键角为角度进行回旋转动,形成类似于圆锥的轨迹。个人理解,供参考,欢迎大虾拍砖。
3楼2012-06-19 16:52:08
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flymice

金虫 (著名写手)

我就是在构建PVDF alfa链的时候出现了点麻烦。我根据上面所提供的信息已经计算了C3和C4的坐标,但是剩余的H原子和F原子坐标不知道怎么计算。里面提到了内旋转角,因此肯定是要利用这两个角度的。
两个内转角分别是179°和45°。
原文描述是这样的:The internal rotation angles of the main chain are 179° and 45 °。
据我的理解,应当是在构建分子结构时,现将C1 C4 C3 C2 放在一个平面上,然后让H3,H4,C2,F1,F2整体绕C3C4键转动179°。
同理,在构建C1'的时候,先将C4, C3, C2,C1‘放在同一个平面上,然后C2, F2, F1, C1', H1’等原子整体绕C3C2键转动45°。
不知道我的理解是否有问题?关键是碳原子可以放在一个平面上,那在转动之前的H原子和F原子应当处于什么位置呢?它们分别跟什么对应?
都不知道这种文章在搞什么,直接把所有原子坐标列出来不就行了么,也就是12个原子。他都已经列了6个了,不在乎多6个吧?描述的话可以添进去,但是要根据描述来画分子结构,对于非化学类的人来说未免太困难点了吧?

PVDF alfa链结构图

Believeinyourself,impossibleisnothing.
5楼2012-06-20 13:33:01
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