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flymice金虫 (著名写手)
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[求助]
求问什么是internal rotational angle？
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如题，小弟不是化学类的，最近建构高分子模型看到了这个词，但是使用百度和google都没能找到它的定义，希望能有高手给我解释一下这个角度的定义。 如果能够给出实例更加好。 |
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3楼2012-06-19 16:52:08
wwxuan1983
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4楼2012-06-19 16:56:37
flymice
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我就是在构建PVDF alfa链的时候出现了点麻烦。我根据上面所提供的信息已经计算了C3和C4的坐标，但是剩余的H原子和F原子坐标不知道怎么计算。里面提到了内旋转角，因此肯定是要利用这两个角度的。 两个内转角分别是179°和45°。 原文描述是这样的：The internal rotation angles of the main chain are 179° and 45 °。 据我的理解，应当是在构建分子结构时，现将C1 C4 C3 C2 放在一个平面上，然后让H3，H4，C2，F1，F2整体绕C3C4键转动179°。 同理，在构建C1'的时候，先将C4, C3, C2，C1‘放在同一个平面上，然后C2， F2， F1， C1', H1’等原子整体绕C3C2键转动45°。 不知道我的理解是否有问题？关键是碳原子可以放在一个平面上，那在转动之前的H原子和F原子应当处于什么位置呢？它们分别跟什么对应？ 都不知道这种文章在搞什么，直接把所有原子坐标列出来不就行了么，也就是12个原子。他都已经列了6个了，不在乎多6个吧？描述的话可以添进去，但是要根据描述来画分子结构，对于非化学类的人来说未免太困难点了吧？  PVDF alfa链结构图 |
5楼2012-06-20 13:33:01
