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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 快速确定杂质原子的位置
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xiongxiong5712

新虫 (小有名气)

[交流] 快速确定杂质原子的位置

建立了一个纳米线模型，对其进行掺杂，我想快速确定掺杂原子所处的位置，其他性质暂时不考虑，是否可以不进行结构优化，直接对掺杂以后的结构计算，得到其总能，比较总能的大小就可以了？请大家指教
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1楼 2012-06-13 15:03:46
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回帖置顶 ( 共有2个 )

redskywei

木虫 (著名写手)
★
xiongxiong5712(金币+1): 谢谢参与
汗，是第一性原理计算么，纳米线都算的下？
一定要做优化的，必须滴~~
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13楼2012-08-15 12:18:56
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phys

木虫 (正式写手)
★
xiongxiong5712(金币+1): 谢谢参与
必须优化，很多人以为计算是万能的，其实人才是万能的
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14楼2012-08-21 10:25:29
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sunboyccc

铁杆木虫 (正式写手)
★
xiongxiong5712(金币+1): 谢谢参与
xueht987: , 谢谢回帖，鼓励交流！ 2012-06-13 22:37:37
应该不行！有时候同一原子两种掺杂位置之间能量差得很少，没有优化或计算精度较粗，也许能滤掉一部分可能。考虑周密的话，还是较高精度优化好一些。
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2楼2012-06-13 16:19:59
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lgf9f18

金虫 (小有名气)
★ ★
xiongxiong5712(金币+1): 谢谢参与
xueht987: 金币+1, 谢谢回帖，鼓励交流！ 2012-06-13 22:37:55
不优化，直接比较能量大小，意义不大，因为此时不能确定你的结构状态（亚稳或稳定）；只有通过优化（局域或全局），才能确定你的结构是否存在、构型怎么样等等问题。另外，对于纳米线的计算，一定要注意纳米线末端的悬挂键或未配对电子的处理，这很重要哦。
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forestwolf9291
3楼2012-06-13 16:20:16
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forestwolf9291

木虫 (著名写手)
★
xiongxiong5712(金币+1): 谢谢参与
送鲜花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by lgf9f18 at 2012-06-13 16:20:16
不优化，直接比较能量大小，意义不大，因为此时不能确定你的结构状态（亚稳或稳定）；只有通过优化（局域或全局），才能确定你的结构是否存在、构型怎么样等等问题。另外，对于纳米线的计算，一定要注意纳米线末端的 ...

同问。能否细说些心得？
对悬挂键是否就是钝化吧。
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4楼2012-06-13 17:22:44
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lwx098

至尊木虫 (著名写手)
★
xiongxiong5712(金币+1): 谢谢参与
不知楼主什么软件，如果完全构建一个和实验结果接近的纳米线需要多少原子？计算量是不是能够承受啊？是不是需要简化为周期结构呢？

---不懂乱问的哦。
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5楼2012-06-13 20:07:55
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xiongxiong5712

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by lgf9f18 at 2012-06-13 16:20:16
不优化，直接比较能量大小，意义不大，因为此时不能确定你的结构状态（亚稳或稳定）；只有通过优化（局域或全局），才能确定你的结构是否存在、构型怎么样等等问题。另外，对于纳米线的计算，一定要注意纳米线末端的 ...

谢谢你的回复，你所说的纳米线末端的悬挂键处理是不是指用H饱和呢？如果不处理悬挂键就直接进行优化行吗？再次感谢
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7楼2012-06-13 22:13:46
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yangy1220

新虫 (职业作家)
★
xiongxiong5712(金币+1): 谢谢参与
祝福楼主
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8楼2012-06-13 22:57:38
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wangziyan3

金虫 (小有名气)
★ ★
xiongxiong5712(金币+1): 谢谢参与
xueht987: 金币+1, 多谢指教！ 2012-06-14 11:01:34
还是得优化的，因为你不确定你不优化的结构是不是会在优化后弛豫到其他稳定态
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10楼2012-06-14 09:14:30
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lgf9f18

金虫 (小有名气)
可能是说法不同，我们称悬挂键就是H饱和，但H饱和只是一个处理手段，钝化的概念一样，在我计算石墨烯硫化时不进行悬挂键处理，性能计算有偏差，如Spin density
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11楼2012-06-14 11:23:21
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10102050756楼
2012-06-13 20:46   回复  
xiongxiong5712(金币+1): 谢谢参与
wangjb4019楼
2012-06-14 09:07   回复  
xiongxiong5712(金币+1): 谢谢参与
期待钝化12楼
2012-06-16 11:54   回复  
xiongxiong5712(金币+1): 谢谢参与
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