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summer2771

木虫 (正式写手)

[求助] 请问做细胞信号转导通路的大神,能否只做磷酸化不做总量?

如题,因为经费缺乏,做总量的话所需经费要翻一翻,所以想请教大家,如果我不做蛋白总量,只通过蛋白质的磷酸化表达水平的改变来反映我干预措施对通路的影响,是否可行呢!?因为看国外同行的论文基本上都是蛋白总量+磷酸化表达这样...
请指教!不胜感激!
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junior850621

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
基本没这么做的。万一(万一概率说低了,基本上是一定的)审稿的发回来让你补上数据,那不光还是要花钱,而且要花时间。
2楼2012-06-13 14:43:45
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summer2771

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
送鲜花一朵
amisking: 金币+3, 鼓励发帖交流问题。 2012-06-13 20:47:49
呵呵,谢谢您的帮助!
您是从很实际的方面来解释的,确实我也担心这个问题!
有朋友说不做总量的话解释结果时会比较难,难以做结论,因为不能解释究竟细胞功能变化来自于总表达的提高还是磷酸化率的提高。 比如磷酸化率都是20%,但是因为总表达增加50%就可能使磷酸化绝对值增加。 是这样的么?
另请教一下,一般每个干预组要做几个样本呢?至少6个么?
3楼2012-06-13 20:06:00
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vir2008

木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by summer2771 at 2012-06-13 20:06:00
呵呵,谢谢您的帮助!
您是从很实际的方面来解释的,确实我也担心这个问题!
有朋友说不做总量的话解释结果时会比较难,难以做结论,因为不能解释究竟细胞功能变化来自于总表达的提高还是磷酸化率的提高。 比如磷 ...

你朋友说得对,主要也就是这个问题。
貌似《Cell》要求六次重复,你要是做得顺,3次都能得出理想的结果,那对一般期刊也够了。

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4楼2012-06-14 08:59:52
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小神-小神

木虫 (正式写手)

理解,
辛苦了,你辛苦了,祝你实验顺利。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

纵横四海
5楼2012-06-14 14:18:58
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summer2771

木虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by vir2008 at 2012-06-14 08:59:52
你朋友说得对,主要也就是这个问题。
貌似《Cell》要求六次重复,你要是做得顺,3次都能得出理想的结果,那对一般期刊也够了。...

谢谢您的帮助!
只能先做3次看看效果了...
6楼2012-06-14 18:15:41
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summer2771

木虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by 小神-小神 at 2012-06-14 14:18:58
理解,
辛苦了,你辛苦了,祝你实验顺利。

呵呵!谢谢谢谢!
控制经费啊...不砍指标,换来的代价就是从两个干预期被砍得只剩余一个干预期...
7楼2012-06-14 18:16:33
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guowang0224

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
summer2771: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 呵呵,您的第一帖就是我这个疑问的应助,选您作为最佳答案,以示感谢!呵呵! 2012-06-16 15:40:24
只要做了蛋白总量,才能看出磷酸的变化效果。我觉得总的是必须要做的
8楼2012-06-16 08:35:06
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