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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 求菌种鉴定分析软件及使用教程
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紫菱Kitty

金虫 (小有名气)

[求助] 求菌种鉴定分析软件及使用教程

一家公司已经给我把菌种鉴定的结果发过来了，但是没标明是什么细菌，只写了一堆碱基什么的。还需要自己分析。求相关软件（好像是两个吧）及使用教程。谢谢！
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1楼 2012-06-13 06:32:22
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castlered

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
是测序结果么？ncbi上blast吧
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2楼2012-06-13 08:54:24
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紫菱Kitty

金虫 (小有名气)
是的，请问怎么使用啊？
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梦随风万里，几度洪辰来去。人面桃花长相忆。又是一年春华成秋碧，莫叹明月笑多情。
3楼2012-06-13 18:35:35
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books

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
DNAMAN处理基因序列，比对上ncbi，blast

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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4楼2012-06-14 07:25:21
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books

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
紫菱Kitty: 金币+3, ★有帮助 2012-06-15 00:27:00
你说的应该是测序公司发的测序结果。bioedit和一个打开AB1格式的软件，自己搜搜吧。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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5楼2012-06-14 07:29:03
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645329775

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
紫菱Kitty: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-06-15 00:26:17
首先ncbi上blast比对,然后再构建系统发育数。不过这样也只能鉴定到属，要鉴定到种的话，还要相关的生理生化试验。
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6楼2012-06-14 23:07:40
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books

木虫 (小有名气)
你可以上知网下几篇菌种鉴定与生物信息学的文献看看，挺多的。
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7楼2012-06-15 10:25:26
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