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gong_107

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[求助] 模拟分子吸附在界面时为什么基团之间不能结合在一起 (有图)

请高手指教

在模拟了一个TiO2（101）界面后，当与H2O结合时，为什么H2O与氧化物表面原子不能连接在一起，可是有的文献中却可以与一些有机物分子很好的结合，这是什么原因。在这里用H2O只是找个简单的东西来试试，我也用较复杂的分子尝试结合，可是也是这样类似的图片，是不是我什么地方搞错了，还是说这是正常的呢？请指教。谢谢！

我用的是Bulid layers功能，在materials studio中完成的。

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1楼2012-06-09 15:42:16

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houfeifan

金虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
御剑江湖: 金币+2, 谢谢回帖 2012-06-15 08:57:19
gong_107: 金币+10, ★有帮助 2012-06-26 16:16:55

这个和H2O距离表面的吸附位的距离有关，初始建模的时候，H2O距离表面的吸附位不能太远了，具体可参考文献，或者自己先跑一下不同距离的单个H2O的，模拟吸附的时候需要跑一下动力学，如果你距离设置合适的话，应该是会发生吸附的。如果我没有理解错的话，H2O应该是吸附在Ti原子上，所以在建模的时候，cleave的surface里面确保有尽量多的Ti

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3楼2012-06-15 07:02:19

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