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gong_107

金虫 (小有名气)

[求助] 模拟分子吸附在界面时为什么基团之间不能结合在一起 (有图)

请高手指教

在模拟了一个TiO2(101)界面后,当与H2O结合时,为什么H2O与氧化物表面原子不能连接在一起,可是有的文献中却可以与一些有机物分子很好的结合,这是什么原因。在这里用H2O只是找个简单的东西来试试,我也用较复杂的分子尝试结合,可是也是这样类似的图片,是不是我什么地方搞错了,还是说这是正常的呢?请指教。谢谢!

我用的是Bulid layers功能,在materials studio中完成的。
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houfeifan

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
御剑江湖: 金币+2, 谢谢回帖 2012-06-15 08:57:19
gong_107: 金币+10, 有帮助 2012-06-26 16:16:55
这个和H2O距离表面的吸附位的距离有关,初始建模的时候,H2O距离表面的吸附位不能太远了,具体可参考文献,或者自己先跑一下不同距离的单个H2O的,模拟吸附的时候需要跑一下动力学,如果你距离设置合适的话,应该是会发生吸附的。如果我没有理解错的话,H2O应该是吸附在Ti原子上,所以在建模的时候,cleave的surface里面确保有尽量多的Ti
3楼2012-06-15 07:02:19
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