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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 二茂铁结构的不同画法，取哪个？
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nedved33

金虫 (小有名气)

[交流] 二茂铁结构的不同画法，取哪个？

在论坛里看到两种二茂铁结构的画法
一种是配位型二茂铁，环戊二烯环与Fe配位

第二种是环戊二烯环上的C原子与Fe有键相连

之前都是按第一种画法算的，
但是导师说画法好像有问题，然后查了CA上的文献，
好像在近5年的外文文献里用到第2种画法较多，第一种几乎没提到，
请问各位高手在进行理论计算时究竟应该选哪种画法？如果有第一种画法，最好能附上相关文献，唉，实在不想把数据重新算一遍
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1楼 2012-05-31 21:04:57
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

cxyuan09

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
nedved33(金币+1): 谢谢参与
gmy1990: 金币+2 2012-06-01 13:47:54
楼主的这两种结构在计算中（如果是量子化学计算的话）是没有区别的；
前面的高手小卒说的对，二茂铁应该是交叉式构象
二苯铬才是重叠式构象。
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5楼2012-06-01 10:15:13
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dreamyeye

木虫 (著名写手)
★
nedved33(金币+1): 谢谢参与
比较一下两种结构优化出来的结果不就行了吗？
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6楼2012-06-01 12:55:28
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375642546

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
nedved33(金币+1): 谢谢参与
gmy1990: 金币+3 2012-06-01 13:48:05
nedved33: 金币+3 2012-06-02 10:57:34
不管是第一种还是第二种，只要是在相同的初始构型基础上用相同的基组和方法进行的计算，在我们量化人看来是没有区别的。文献中多用第二种是因为第二种看起来更漂亮，更直观。作图的目的是清晰直观地表达自己要表达的东西，而漂亮可以为这种表达锦上添花。
楼上有虫友提到交叉式和重叠式的问题，这两个构象的能量差并不是很大，有时候重叠式也是存在的（出处是张青莲老先生的无机化学丛书，记不大清楚第几卷了，楼主也可以亲自算一下），很可能是常温下随便转那种。需要一提的是，交叉式确实更稳定。
参考文献：J. Mol. Graphics. Modell. 2011, 29, 717-725.

[ Last edited by 375642546 on 2012-6-1 at 13:09 ]
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7楼2012-06-01 13:08:42
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yoghurt117

木虫 (正式写手)
★
nedved33(金币+1): 谢谢参与
以前人家给我的测出的晶体结构确实是交叉构象
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8楼2012-06-01 23:01:41
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nedved33

金虫 (小有名气)
谢谢各位高手
另外选重叠式是因为我算的是气相中的二茂铁，气相中二茂铁构型以eclipsed structure(D5h)最稳定,晶体结构的确是交叉式最稳定
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9楼2012-06-02 10:54:19
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ljf2012

金虫 (职业作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
哪位能附上一副交叉构象的图呢！
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10楼2013-03-04 12:30:51
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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)
★
nedved33(金币+1): 谢谢参与
一般用的都是交叉式的能量较低，而若是加上取代基不同，那就不一定最低
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3楼2012-06-01 09:41:59
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)
★ ★ ★
nedved33(金币+1): 谢谢参与
gmy1990: 金币+2 2012-06-01 13:47:50
请问各位高手在进行理论计算时究竟应该选哪种画法？
==========
1 我不是高手
2 我哪种都不选 我选交叉式构象
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4楼2012-06-01 09:57:06
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ririgay

木虫 (小有名气)
学习了！
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11楼2013-04-11 15:15:21
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yongleli

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
10楼: Originally posted by ljf2012 at 2013-03-04 12:30:51
哪位能附上一副交叉构象的图呢！

Chemical Physics Letters 2009, 482 (4–6), 217-222.
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12楼2013-04-12 10:13:07
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goingabroad2楼
2012-05-31 21:27   回复  
nedved33(金币+1): 谢谢参与
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