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nedved33

金虫 (小有名气)

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[交流] 二茂铁结构的不同画法，取哪个？

在论坛里看到两种二茂铁结构的画法
一种是配位型二茂铁，环戊二烯环与Fe配位

第二种是环戊二烯环上的C原子与Fe有键相连

之前都是按第一种画法算的，
但是导师说画法好像有问题，然后查了CA上的文献，
好像在近5年的外文文献里用到第2种画法较多，第一种几乎没提到，
请问各位高手在进行理论计算时究竟应该选哪种画法？如果有第一种画法，最好能附上相关文献，唉，实在不想把数据重新算一遍

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1楼 2012-05-31 21:04:57

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cxyuan09

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gmy1990: 金币+2 2012-06-01 13:47:54

楼主的这两种结构在计算中（如果是量子化学计算的话）是没有区别的；
前面的高手小卒说的对，二茂铁应该是交叉式构象
二苯铬才是重叠式构象。

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5楼2012-06-01 10:15:13

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dreamyeye

木虫 (著名写手)

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★
nedved33(金币+1): 谢谢参与

比较一下两种结构优化出来的结果不就行了吗？

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6楼2012-06-01 12:55:28

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375642546

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gmy1990: 金币+3 2012-06-01 13:48:05
nedved33: 金币+3 2012-06-02 10:57:34

不管是第一种还是第二种，只要是在相同的初始构型基础上用相同的基组和方法进行的计算，在我们量化人看来是没有区别的。文献中多用第二种是因为第二种看起来更漂亮，更直观。作图的目的是清晰直观地表达自己要表达的东西，而漂亮可以为这种表达锦上添花。
楼上有虫友提到交叉式和重叠式的问题，这两个构象的能量差并不是很大，有时候重叠式也是存在的（出处是张青莲老先生的无机化学丛书，记不大清楚第几卷了，楼主也可以亲自算一下），很可能是常温下随便转那种。需要一提的是，交叉式确实更稳定。
参考文献：J. Mol. Graphics. Modell. 2011, 29, 717-725.

[ Last edited by 375642546 on 2012-6-1 at 13:09 ]

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7楼2012-06-01 13:08:42

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