24小时热门版块排行榜    

查看: 2843  |  回复: 11

yanglina062

银虫 (小有名气)

[求助] 用quantum espresso 软件来计算染料分子吸附在cluster 表面后的光谱性能

请问一下高手们,如何将吸附于二氧化钛cluster表面的染料分子这整个体系的坐标信息弄到PWscf的输入文件里面?论坛上看到有用MS先建模,castep运行后将其坐标信息导入的。可是我这个是cluster,我不知道用pwscf计算的时候cluster的坐标是不是和周期性体系的一样,可以用这种方法来做,还有就是如果是cluster,它的真空层就没法建了。可是有文献提到这种情况还有在三个方向都建真空层的,不知道怎么回事,还望牛人给指导一下,谢谢!
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

建模

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

come on!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
fzx2008: 金币+2, 专家考核, 谢谢指教 2012-05-17 19:39:38
在MS中建立个大box,然后把cluster模型扔进去就成了~重要的是box一定要足够大~
思想重于技巧,内涵重于表象
2楼2012-05-17 17:17:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yanglina062

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by souledge at 2012-05-17 17:17:02:
在MS中建立个大box,然后把cluster模型扔进去就成了~重要的是box一定要足够大~

那真空层大小不需要考虑了么?
come on!
3楼2012-05-17 19:20:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yanglina062

银虫 (小有名气)

您帮我看看,我把模型建成这样行不行,谢谢了!


come on!
4楼2012-05-17 19:35:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖


fzx2008: 金币+1, 专家考核, 谢谢指教 2012-05-18 08:34:06
引用回帖:
4楼: Originally posted by yanglina062 at 2012-05-17 19:35:57:
您帮我看看,我把模型建成这样行不行,谢谢了!
9b/fd/1573758_1337254544_515.png

不知道,盒子的大小要自己多算几个尺寸才成,没人能提供你现成的答案。
思想重于技巧,内涵重于表象
5楼2012-05-17 20:08:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yanglina062

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by souledge at 2012-05-17 20:08:50:
不知道,盒子的大小要自己多算几个尺寸才成,没人能提供你现成的答案。

哦,好的。谢谢!
come on!
6楼2012-05-17 21:37:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

goldenfisher

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
fzx2008: 金币+2, 专家考核, 谢谢指教 2012-05-18 08:34:18
一般各个真空层方向距离为10A左右足够了,但是也要看体系,如果有大分子或者相互作用距离较远的体系,可能需要大一些。
7楼2012-05-18 00:34:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yanglina062

银虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by goldenfisher at 2012-05-18 00:34:27:
一般各个真空层方向距离为10A左右足够了,但是也要看体系,如果有大分子或者相互作用距离较远的体系,可能需要大一些。

可是MS目前不是只可以在一个方向上加真空层么?而且我不知道cluster怎么才能知道各个方向真空层的距离。还恳请专家指导一下。谢谢!
come on!
8楼2012-05-18 09:06:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

goldenfisher

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
fzx2008: 金币+2, 专家考核, 谢谢指教 2012-05-19 08:22:23
yanglina062: 金币+3, ★★★★★最佳答案, 非常感谢您的帮助! 2012-05-19 08:35:17
引用回帖:
8楼: Originally posted by yanglina062 at 2012-05-18 09:06:39:
可是MS目前不是只可以在一个方向上加真空层么?而且我不知道cluster怎么才能知道各个方向真空层的距离。还恳请专家指导一下。谢谢!

这个是很简单的事情,只要拉大你的晶格常数而你的原子位置不变就行。
另外,一般而言,比如对你的碳纳米管,只需要在两个方向加真空,因为是一维周期性结构。
9楼2012-05-19 01:34:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gongjijun

木虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by goldenfisher at 2012-05-18 00:34:27:
一般各个真空层方向距离为10A左右足够了,但是也要看体系,如果有大分子或者相互作用距离较远的体系,可能需要大一些。

您好,“相互作用距离较远的体系” 这句话该如何理解?
10楼2012-05-19 09:15:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yanglina062 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +8 majunge000 2026-08-10 9/450 2026-08-12 22:17 by 虫友是什么虫
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +10 Tide man 2026-08-11 10/500 2026-08-12 20:59 by 陈晨晨陈啊
[基金申请] filecode +13 documentary 2026-08-10 15/750 2026-08-12 15:56 by 云上清扬
[论文投稿] 职称评审,求友友推荐见刊最快的期刊 +4 工厂打螺丝 2026-08-08 4/200 2026-08-12 09:18 by hansi2025
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +8 Tide man 2026-08-10 9/450 2026-08-11 20:39 by beefly
[硕博家园] 读博的好处 +3 lnee 2026-08-11 3/150 2026-08-11 18:10 by 希望我好好的
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 听说今天filecode变了 +26 布布和一二 2026-08-06 49/2450 2026-08-11 13:18 by WH3796
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +8 家与远方 2026-08-10 13/650 2026-08-11 09:49 by 家与远方
[基金申请] 静等基金结果 +5 gjjjzhong 2026-08-10 16/800 2026-08-10 17:19 by Tide man
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +5 yang182083 2026-08-06 7/350 2026-08-08 18:29 by zhanghaozhu
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] 大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
信息提示
请填处理意见