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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 提取植物组织中的微生物基因组
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nlhnq55

银虫 (小有名气)

[求助] 提取植物组织中的微生物基因组

急需从植物组（如花朵，子房等）中提取微生物基因组(metagenome)，传统的CTAB等方法及国内相关的试剂盒都难以克服试剂中微生物DNA片段污染的问题（即试剂盒的空白提取仍然会有微生物DNA的污染），只能寄希望于国外试剂盒。请各位大侠不吝介绍相关的试剂盒啊，万分感谢！！！
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无穷般若心自在，语默动静体自然
1楼 2012-05-16 15:25:37
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zhsp07

金虫 (小有名气)
请教一下，楼主的问题解决了吗？我也是打算提取植物根部的内生菌总DNA，PCR后，做宏基因组分析，楼主是怎么提总DNA的，烦请不吝赐教。
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车到山前必有路!
5楼2013-03-06 10:23:04
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zhsDONG

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
nlhnq55: 金币+2 2012-05-17 14:31:45
可以先从组织中分离内生菌，在进行内生菌DNA的提取呀！
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2楼2012-05-16 17:09:05
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nlhnq55

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhsDONG at 2012-05-16 17:09:05:
可以先从组织中分离内生菌，在进行内生菌DNA的提取呀！

我想获得做metagenome检测，从组织中分离内生菌，会发生大量的菌群难以分离培养的情况啊
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无穷般若心自在，语默动静体自然
3楼2012-05-17 14:30:07
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swaucq

金虫 (正式写手)
推荐你一篇文章，关于植物内生菌提DNA建库的。或许有帮助。Wang, H.-X., Y. Zeng, and Y.-M. Shen, Enriching plant microbiota for a metagenomic library construction. Environmental Microbiology, 2008. 10(10): p. 7.
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不卑不亢
4楼2012-05-17 22:34:08
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