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nlhnq55

银虫 (小有名气)

[求助] 提取植物组织中的微生物基因组

急需从植物组(如花朵,子房等)中提取微生物基因组(metagenome),传统的CTAB等方法及国内相关的试剂盒都难以克服试剂中微生物DNA片段污染的问题(即试剂盒的空白提取仍然会有微生物DNA的污染),只能寄希望于国外试剂盒。请各位大侠不吝介绍相关的试剂盒啊,万分感谢!!!
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无穷般若心自在,语默动静体自然
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zhsp07

金虫 (小有名气)

请教一下,楼主的问题解决了吗?我也是打算提取植物根部的内生菌总DNA,PCR后,做宏基因组分析,楼主是怎么提总DNA的,烦请不吝赐教。
车到山前必有路!
5楼2013-03-06 10:23:04
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zhsDONG

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
nlhnq55: 金币+2 2012-05-17 14:31:45
可以先从组织中分离内生菌,在进行内生菌DNA的提取呀!
2楼2012-05-16 17:09:05
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nlhnq55

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhsDONG at 2012-05-16 17:09:05:
可以先从组织中分离内生菌,在进行内生菌DNA的提取呀!

我想获得做metagenome检测,从组织中分离内生菌,会发生大量的菌群难以分离培养的情况啊
无穷般若心自在,语默动静体自然
3楼2012-05-17 14:30:07
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swaucq

金虫 (正式写手)

推荐你一篇文章,关于植物内生菌提DNA建库的。或许有帮助。Wang, H.-X., Y. Zeng, and Y.-M. Shen, Enriching plant microbiota for a metagenomic library construction. Environmental Microbiology, 2008. 10(10): p. 7.
不卑不亢
4楼2012-05-17 22:34:08
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