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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 综合其他 » 求助Shelxtl 作图指令，奖励50个金币。
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376388337

铁虫 (小有名气)

[求助] 求助Shelxtl 作图指令，奖励50个金币。

用Shelxtl 作分子间作用图时，大分子之间通过六个水分子形成的氢键连接在一起(如图所示)。但是我用Shelxtl打开分子结构时，只有三个水分子。请问通过什么指令能长出我们需要的水分子和相邻的大分子。[ Last edited by 376388337 on 2012-5-16 at 13:08 ]
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    • 2012-05-16 12:54:21, 479.54 K

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1楼 2012-05-16 12:54:28
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回帖置顶 ( 共有1个 )

rogersystop

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
376388337: 金币+10, ★★★很有帮助, 4楼的回复较满意，但是回答的不全面，先给10个金币。希望能回答的深入些，追加金币哦。 2012-05-16 17:40:58
lijunjie84: 金币+1 2012-05-16 18:22:21
lijunjie84: , 欢迎发帖交流！！！！！！！ 2012-05-16 18:22:32
lijunjie84: 回帖置顶 2012-05-16 18:22:37
376388337: 金币+10, ★★★很有帮助, 过了这么久，只有你的回答比较专业，再追加10个金币。 2012-05-18 12:48:50
一个一个长呗，
比如 sgen 5556 o1这样打
具体的代码和原子名看envi咯
赞一下 回复此楼
4楼2012-05-16 13:39:51
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普通回帖

huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lijunjie84: 金币+1 2012-05-16 18:22:00
lijunjie84: , 欢迎 发帖交流！ 2012-05-16 18:22:08
376388337: 金币+2, ★有帮助, 帮助不太大，感谢你的参与。 2012-05-18 12:46:36
可以考虑画堆积图 pbox pack
或者envi sgen慢慢长
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2楼2012-05-16 13:13:48
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376388337

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by huahua1216 at 2012-05-16 13:13:48:
可以考虑画堆积图 pbox pack
或者envi sgen慢慢长

一用sgen指令，就会长很多不想要的分子，有没有办法只长某个想要的分子？
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3楼2012-05-16 13:35:32
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376388337

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by rogersystop at 2012-05-16 13:39:51:
一个一个长呗，
比如 sgen 5556 o1这样打
具体的代码和原子名看envi咯

rogersystop，你好。如果我采用了sgen指令和具体的代码，具体的原子名，只长出来一个原子。但是这个原子属于一个很大分子的一部分，有没有方法可以很快长出来这个大分子，同时不长额外的不需要的分子？请大家踊跃回答，我回追加金币的。
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5楼2012-05-16 17:43:52
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calory

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
linhua0402313: 金币+1, 感谢回帖交流！ 2012-05-18 13:33:36
采用了sgen指令和具体的对称操作码，不要加具体的原子名，长出来的就是一个大分子吧？
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6楼2012-05-17 15:45:12
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376388337

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by calory at 2012-05-17 15:45:12:
采用了sgen指令和具体的对称操作码，不要加具体的原子名，长出来的就是一个大分子吧？

不是啊，我的长出来很多分子
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7楼2012-05-18 12:39:34
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qiushui12

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
linhua0402313: 金币+1, 感谢回帖交流！ 2012-05-18 13:33:46
如果单纯为了作图，就join n Om HX 这样连接合理的氢键就OK,n=3是显示虚线
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8楼2012-05-18 12:49:05
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376388337

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by qiushui12 at 2012-05-18 12:49:05:
如果单纯为了作图，就join n Om HX 这样连接合理的氢键就OK,n=3是显示虚线

溶剂分子太多。需要长很多水分子，和与水分子有作用的主体分子。我的问题是如何快速而又准确的长出来这些水分子。关于连接氢键，这个我会，不过仍然谢谢你的参与。
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9楼2012-05-18 12:53:39
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rogersystop

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
linhua0402313: 金币+1, 感谢回帖交流！ 2012-05-18 13:33:55
如果要长的原子太多的话就不推荐用xp画了，弄得太麻烦。
考虑一下diamond吧
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10楼2012-05-18 12:59:16
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