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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 请问高手们，sybyl对接出来的打分值怎么转换成结合能？
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wohaihao

荣誉版主 (著名写手)

[交流] 请问高手们，sybyl对接出来的打分值怎么转换成结合能？

如题，好像有个计算公式？

[ Last edited by wohaihao on 2012-5-9 at 18:48 ]
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wohaihao

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1楼 2012-05-09 17:10:31
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wendaoliuxu

捐助贵宾 (小有名气)
★
wohaihao(金币+1): 谢谢参与
帮忙顶一下。sybyl打分时候没有提供对接的原始文件么？
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2楼2012-05-09 20:58:17
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药物设计

捐助贵宾 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
wohaihao(金币+1): 谢谢参与
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-05-11 12:21:42
wohaihao: 金币+8, 3Q 2012-05-25 09:36:08
Surflex-Dock的打分 total score=-logKd（Kd为解离平衡常数），标况下结合自由能 DeltaG0=-RTlnKa （Ka为结合平衡常数，Ka=1/Kd）。
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3楼2012-05-11 11:35:56
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wohaihao

荣誉版主 (著名写手)
送鲜花一朵
谢谢了，我看看怎么转换成公式
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4楼2012-05-11 12:37:11
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dragonli

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-06-04 10:48:50
转换成公式
△G0 = -2.303RT*total score
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5楼2012-06-04 10:45:14
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wohaihao

荣誉版主 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by dragonli at 2012-06-04 10:45:14
转换成公式
△G0 = -2.303RT*total score

是不是这个样子的？
△G0 =-2.303*8.314*0.001*298.15*total score
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6楼2012-06-06 10:55:06
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