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微笑生活

铜虫 (小有名气)

[求助] 请问有没有会用PAML软件的?已有1人参与

请熟悉PAML的高手帮帮忙啊
我用枝-位点模型在前景枝上得到几个正选择位点,可是背景枝稍微增加或减少以后,得到的正选择位点就会变化,这是怎么回事呢

另外,怎样把结果中的正选择位点map到氨基酸序列上呢,为什么我每次按提供的序号都没办法找到那些位点?
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zyworkgroup

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

Branch-site models 就是希望扣除背景枝的干扰,发现正选择的存在,然后进一步通过计算相应位点的后验概率,确定正选择的作用位点。确定操作没有问题,那可能就是软件本身的问题了。可以试试其他的软件计算一下。
2楼2013-04-06 10:50:01
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