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396101466金虫 (正式写手)
一段遗失的美好
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[求助]
有关PDB数据库的使用问题
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最近做一个关于蛋白质3D结构相关的实验，涉及到蛋白质的空间构象，以及蛋白质在实验过程中的相关变化，所以要用到PDB数据库里面的蛋白质的空间结构。有做相关的大侠，可进来交流一下。 1.首先，我想问问，我只是知道蛋白质的名称，不知道蛋白质的检索ID怎么去检索其相应的3D结构？ 2.PDB数据库有木有收录同种蛋白质的不同的聚体形式，比喻单体和二聚体的3D结构？如果有这样的，；请问你怎么检索？ 3.能检索到相关3D结构的是蛋白是不是都是改蛋白在结晶状态下的3D结构？ 期待和给位大侠们交流！ |
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12楼2012-09-22 09:10:16
396101466
金虫 (正式写手)
一段遗失的美好
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谢谢！3楼2012-05-04 18:48:09
zhaoweigang
金虫 (知名作家)
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4楼2012-05-04 19:27:31
98765432112
新虫 (初入文坛)
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
hsd3521: 回帖置顶 2012-05-05 08:53:39
hsd3521: 金币+1, 感谢关注食品版，谢谢 2012-05-05 08:53:51
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hsd3521: 回帖置顶 2012-05-05 08:53:39
hsd3521: 金币+1, 感谢关注食品版，谢谢 2012-05-05 08:53:51
| 进入PDB数据库网页：http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do 输入蛋白质名称，对于一种蛋白可能有很多种晶体结构，收录到PDB数据库，这个你可以根据它们的描述去选择你需要的晶体图，下载它们PDB格式的图即可，这些图需要相应的软件才可以打开，如：pyMOL |
5楼2012-05-04 22:17:59