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javy金虫 (正式写手)
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[交流]
交流]用multiwfn分析轨道组成的时候碰到的问题 已有2人参与
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大家好，在学习multiwfn的过程中，碰到的一些问题（使用的是2.3.3 windows版本的），要麻烦各位了。 1. 主要是想使用SCPA方法分析某个分子轨道中某分子碎片(比如原子2-10)的组成比例 进入主菜单,选择" 8 Orbital composition analysis"后,定义了所要研究的分子碎片 ,但是只有这个选项" 6 Print frag. 1 compositions in all orbitals (SCPA)"来完成我要研究的问题,因为我的这个分子中有1000多个分子轨道,这样输出的话很耗时间. 如果选择的是" 3 Orbital composition analysis with Ros-Schuit (SCPA) partition",虽然可以对某个分子轨道进行选择,但是输出的是基函数,壳层和原子轨道在这个分子轨道中的贡献,也就是说,之前定义的分子碎片(比如原子2-10)在这里没有作用了. 难道只能自己把数据拷出来,加和所研究的分子碎片中对应的原子的贡献么? 好象说的罗嗦了点，这个问题其实就是Sample Text谢谢 2. 在使用NAO方法分析某个分子轨道中某分子碎片的组成比例.使用该方法虽然可以通过" 1 Show fragment contribution in a range of orbitals"得到某一指定范围内的分子轨道中某一分子碎片的组成比例.但是在指定分子碎片的时候,没办法指定一个范围内的原子(比如,我想把原子2-50这49个原子定义为我所要研究的分子碎片),难道只能通过"a 2,3,4,5,6,7,8..."这样来逐个写入么? 而在用scpa方法的时候可以通过"cond"来指定范围.这个问题就是想知道Sample Text 3. 还有想知道,当退出multiwfn界面的时候,闪过的那几行"unknown ..."什么的,具体是什么啊?闪太快了，没看清楚,还是就我这边会碰到这个问题?大家有碰到么?因为我Sample Text~ 主要我是在用NAO分析时候,输入文件是用gaussian计算的(有NAO轨道系数),确定加了"pop=nboread"和"$NBO NAOMO $END",只不过所研究的体系含有重元素,采用了赝势基组，不知道是否有影响. 谢谢~ 谢谢大家~ |
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1 大量数据在屏幕上输出是需要一些时间，可以使用重定向方法将结果输出到文件里，这样输出速度就会很快，见手册5.2。另外，Linux版本的命令行窗口输出速度比windows的快得多，有条件的话用Linux版本也行。 在即将发布的2.4版中，我会让选项1~3的输出信息的末尾也输出自定义片段的总成分。 2 在2.4版中NAO方法将可以用比如a 2-50这种输入方法把2~50号原子都加入片段中。 3 用户直接退出时出现的unknown之类的信息是编译器的调试信息，用户不必理会它。用赝势没关系。 2.4版将在最近几天内发布，请关注multiwfn网站。 |
3楼2012-05-03 14:04:59
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javy
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