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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 计算neb出错，请高手帮忙看看
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jixiao0526

金虫 (小有名气)

[求助] 计算neb出错，请高手帮忙看看

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1楼2012-05-01 16:29:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gfei2008

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
WDD880227: 金币+2, 感谢交流提示 2012-05-03 08:26:53
计算NEB需要单独编译vasp，不知道你是否把那部分编译进去了？要是没有请参考http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/downloads/
#PBS -l nodes=2:ppn=8用的是2个节点，8个核。你可以根据你的要求和你的机器调整。
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15楼2012-05-02 20:32:48
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 28 个回答

jixiao0526

金虫 (小有名气)
这是任务提交文件

#!/bin/bash
#PBS -N 2-O
#PBS -o vasp.out
#PBS -e vasp.err
#PBS -q dftsoft
#PBS -l nodes=2:ppn=8
np=`wc -l <$PBS_NODEFILE`
cat  $PBS_NODEFILE
/home/dftsoft/vasp_build/mpich2-1.3.1/bin/mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $np  /home/dftsoft/vasp_build/vasp.5.2/vasp_gobals_ifort
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2楼2012-05-01 16:36:38
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likai0106

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
WDD880227: 金币+2, 感谢您的细心解答 2012-05-02 18:39:01
引用回帖:
2楼: Originally posted by jixiao0526 at 2012-05-01 16:36:38:
这是任务提交文件

#!/bin/bash
#PBS -N 2-O
#PBS -o vasp.out
#PBS -e vasp.err
#PBS -q dftsoft
#PBS -l nodes=2:ppn=8
np=`wc -l <$PBS_NODEFILE`
cat  $PBS_NODEFILE
/home/dftsoft/vasp_build/ ...

两个问题，第一你的INCAR不存在
          第二你在INCAR中没有设置IMAGES=这个值
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3楼2012-05-02 09:40:32
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jixiao0526

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by likai0106 at 2012-05-02 09:40:32:
两个问题，第一你的INCAR不存在
          第二你在INCAR中没有设置IMAGES=这个值

两个问题都不是…
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4楼2012-05-02 10:25:45
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