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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » 用pubcif做表格的错误
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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wzgynkmlhf

金虫 (著名写手)

[求助] 用pubcif做表格的错误

如题，我用pubcif 加做一个选择的键角键长表格（默认的设置只给出了氢键表），按照陈小明的书，在选择的地方，把？ 改成yes。
用工具中的检查以后，就出现了如下的错误，请高手指点如何解决这个问题？

Number of loop elements not multiple of packetsize at line 235


loop_
_geom_angle_atom_site_label_1
_geom_angle_atom_site_label_2
_geom_angle
_geom_angle_site_symmetry_1
_geom_angle_publ_flag
N1 Nd1 N1 85.5(2) 8_666 5_665 ?
N1 Nd1 N1 136.93(9) 8_666 3_655 yes
N1 Nd1 N1 78.95(18) 5_665 3_655 yes
  错误上面的，我把？ 改成了yes后，
就出现下面的行数
loop_ -------------------------235 _geom_torsion_atom_site_label_1
_geom_torsion_atom_site_label_2
_geom_torsion_atom_site_label_3
_geom_torsion_atom_site_label_4
_geom_torsion
_geom_torsion_site_symmetry_1
_geom_torsion_site_symmetry_2
_geom_torsion_site_symmetry_3
_geom_torsion_site_symmetry_4
_geom_torsion_publ_flag
N1 Nd1 N1 C1 9.5(11) 8_666 . . . ?
N1 Nd1 N1 C1 -61.5(11) 5_665 . . . ?
N1 Nd1 N1 C1 -142.3(10) 3_655 . . . ?
N1 Nd1 N1 C1 78.1(11) 10_556 . . . ?
N1 Nd1 N1 C1 146.7(11) 12_656 . . . ?
O1 Nd1 N1 C1 -101.0(11) . . . . ?
O1 Nd1 N1 C1 10.0(10) 3_655 . . . ?
O1 Nd1 N1 C1 147.2(11) 8_666 . . . ?

请高人指点。
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1楼 2012-04-28 16:27:29
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wzgynkmlhf

金虫 (著名写手)
估计都去过五一啦。顶一个。
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2楼2012-04-28 16:43:17
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chilajiao

金虫 (知名作家)

深海家族No.1

优秀版主
★
linhua0402313: 金币+1, 感谢回帖交流！ 2012-04-28 17:26:51
这是我的部分cif文件，当时的键长部分是编辑帮忙弄的，你对比看一下吧，不知道是改成 yes  还是   y？
loop_
_geom_bond_atom_site_label_1
_geom_bond_atom_site_label_2
_geom_bond_distance
_geom_bond_site_symmetry_2
_geom_bond_publ_flag
Ni1 O2 2.0052(16) . y
Ni1 O3 2.0103(18) . y
Ni1 O6 2.0312(17) 3_565 y
Ni1 N2 2.0720(19) . y
Ni1 O6 2.0743(16) . y
Ni1 O1 2.2897(18) . y
Ni1 Ni1 2.9988(7) 3_565 ?
Ni2 O2 1.9699(16) . y
Ni2 N1 2.018(2) . y
Ni2 O6 2.0282(16) . y
Ni2 O5 2.0608(18) . y
Ni2 O4 2.1709(19) . y
Ni2 N2 2.209(2) 3_565 y



C6 O1 1.380(3) . ?
C6 C1 1.382(3) . ?
C6 C5 1.413(3) . ?
C5 O2 1.318(3) . ?
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wzgynkmlhf
只爱乐儿
3楼2012-04-28 16:59:00
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wzgynkmlhf

金虫 (著名写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by chilajiao at 2012-04-28 16:59:00:
这是我的部分cif文件，当时的键长部分是编辑帮忙弄的，你对比看一下吧，不知道是改成 yes  还是   y？
loop_
_geom_bond_atom_site_label_1
_geom_bond_atom_site_label_2
_geom_bond_distance
_geo ...

请应助，以便给您金币。谢谢。我先试试看。
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4楼2012-04-28 17:05:55
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chilajiao

金虫 (知名作家)

深海家族No.1

优秀版主
引用回帖:
4楼: Originally posted by wzgynkmlhf at 2012-04-28 17:05:55:
请应助，以便给您金币。谢谢。我先试试看。



金币都是浮云，留着玩吧
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wzgynkmlhf
只爱乐儿
5楼2012-04-28 17:19:21
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wzgynkmlhf

金虫 (著名写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by chilajiao at 2012-04-28 17:19:21:


金币都是浮云，留着玩吧

衷心感谢。
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6楼2012-04-28 17:32:06
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wzgynkmlhf

金虫 (著名写手)
问题已经在上面的大侠的提示下，我全改成y，然后用记事本打开CIF文件，替换问号为Y，然后再用pubcif软件打开，就没有错误了。
这个软件很能折腾人。
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7楼2012-04-28 17:34:22
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chilajiao

金虫 (知名作家)

深海家族No.1

优秀版主
引用回帖:
7楼: Originally posted by wzgynkmlhf at 2012-04-28 17:34:22:
问题已经在上面的大侠的提示下，我全改成y，然后用记事本打开CIF文件，替换问号为Y，然后再用pubcif软件打开，就没有错误了。
这个软件很能折腾人。

陈小明还真是写的 yes

老外的软件哪能符合国人习惯
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只爱乐儿
8楼2012-04-28 18:30:42
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