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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

[求助] 跑第一性原理分子动力学用配多大的计算硬件?

以前是做第一性原理结构优化和静态性质计算,一般100核以内就可以基本满足要求。

现在想关第一性原理分子动力学(BOMD&CPMD)。希望给个概念:

(1)第一性原理分子动力学现在一般(非做方法,只是应用)跑多少个原子的体系;
(2)就上海超算中心的配置来讲,需要租用多少个核。
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goldenfisher

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
cenwanglai: 金币+5, ★★★很有帮助, 非常感谢~ 2012-04-24 12:41:11
fzx2008: 金币+3, 专家考核, 谢谢指教 2012-04-24 12:42:28
这取决于你做多大的体系,然后再取决于你研究什么性质。如果你只是研究常温或者熔化温度左右的温度,且体系也在100个原子左右,那你之前的机器也够用了。但是,ABMD需要的时间很长,一般至少几天以上。所以,如果你要同时跑很多作业,那就得多要节点了。我通常做凝聚态范围内的MD的话,一百个原子左右,且不包含稀有金属等电子很多的体系,我每个左右32-64个节点足够。有些大的体系,且计算时间要很长的体系,需要128-256个核。所以,你自己可以估量一下。
2楼2012-04-24 12:23:13
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goldenfisher

金虫 (著名写手)

前面说错了,是32-64个核。
3楼2012-04-24 12:23:56
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