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岳5253

铁虫 (初入文坛)

[求助] 新手,求助!!!!!

我只知道朗德鹅ACSL1基因的mRNA序列,不知道DNA序列,想扩增DNA序列,应该怎么设计引物呢?
希望大家可以给予指点,谢谢啦
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking: 金币+2, 鼓励帮助解答,欢迎继续交流。 2012-04-10 20:42:46
只知道mRNA序列也不是坏事呀,mRNA序列里面是去掉了内含子的。直接根据mRNA序列两端序列设计引物就是。
2楼2012-04-10 20:04:21
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孙启亮

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking: 金币+2, 鼓励帮助解答,欢迎继续交流。 2012-04-10 20:42:52
去NCBI搜他的开放阅读框啊,搜到后扩增全序列就可以了。设计引物的话那就是应该在开放阅读框前面截取部分碱基,再从后面截取一部分就好了。
3楼2012-04-10 20:35:04
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孙启亮

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

amisking: , 问题最好在一个帖子中回答 2012-04-10 20:43:32
引用回帖:
3楼: Originally posted by 孙启亮 at 2012-04-10 20:35:04:
去NCBI搜他的开放阅读框啊,搜到后扩增全序列就可以了。设计引物的话那就是应该在开放阅读框前面截取部分碱基,再从后面截取一部分就好了。

若不会使用NCBI搜开放阅读框,可参考下面附件中的文章

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  • 附件 1 : 教你使用NCBI.pdf
  • 2012-04-10 20:36:57, 1.74 M
4楼2012-04-10 20:37:04
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岳5253

铁虫 (初入文坛)

岳5253: 回帖置顶 2012-04-12 00:47:33
引用回帖:
4楼: Originally posted by 孙启亮 at 2012-04-10 20:37:04:
若不会使用NCBI搜开放阅读框,可参考下面附件中的文章

谢谢你,我在NCBI上找到了和这个基因相关的序列,但是不太会设计
5楼2012-04-11 20:51:16
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岳5253

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lxj341401 at 2012-04-10 20:04:21:
只知道mRNA序列也不是坏事呀,mRNA序列里面是去掉了内含子的。直接根据mRNA序列两端序列设计引物就是。

我是要做SSCP,mRNA有3000多bp,师兄说这个基因可能太大,我也不知道怎么办了
6楼2012-04-12 13:56:22
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岳5253

铁虫 (初入文坛)

补充一下  我是要做SSCP的  谢谢大家
7楼2012-04-12 13:59:16
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
岳5253: 金币+1, ★★★很有帮助 2012-04-13 09:29:12
西瓜: 金币+1, 应助指数+1, Good! 2012-04-13 18:37:27
引用回帖:
6楼: Originally posted by 岳5253 at 2012-04-12 13:56:22:
我是要做SSCP,mRNA有3000多bp,师兄说这个基因可能太大,我也不知道怎么办了

做SSCP的话中间选取一段设计引物。
8楼2012-04-12 14:13:49
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hjyxm

铁杆木虫 (正式写手)

是否可以将mRNA序列反转录成DNA序列,然后用primer5.0和oligo6.7设计引物
好好工作!
9楼2012-04-13 17:09:33
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岳5253

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by hjyxm at 2012-04-13 17:09:33:
是否可以将mRNA序列反转录成DNA序列,然后用primer5.0和oligo6.7设计引物

恩 谢谢你  我 问了相关的老师  说可以设计引物  我先试试  不行就试试你说的方法   呵呵呵
10楼2012-04-17 14:40:54
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