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虫子火箭兵

金虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by dfm1987 at 2012-04-14 10:20:27
谢谢!但是我扩增的方向好像没有错,是往RB区域以外扩增的,但是得到1000bp左右的RB上游载体序列,没有得到植株基因组的序列...

我目前也遇到了同样的问题,第三轮特异条带大概是3kb,但是没有植物基因组的信息,都是载体信息,也是RB外侧基因,有些文献报道可能是骨架确实是插入到植物染色体中,可以根据已知的序列继续设计引物TAIL,
11楼2013-05-10 11:17:21
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qin.xiaoyue

铁虫 (初入文坛)

我用的是pPZPY122载体,也是遇到相同的情况,从RB向外设计的引物,测序得到的结果却是RB上游的结果。同求高人指点。
12楼2014-01-10 14:38:42
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hnsdtlf

新虫 (初入文坛)

我现在也在做PB121的插入位点侧翼序列分析,困惑的是我现在无法确认RB与LB的序列,因此也不能设计特异引物,可不可以告诉我两侧的侧翼序列?急求
13楼2014-03-20 11:01:54
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hnsdtlf

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

求助PB121的两侧LB与RB序列
14楼2014-03-20 11:10:19
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0405lanfeng

新虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by lzh860801 at 2012-04-10 17:10:04
lz你的情况和我很相似啊
我是设计的LB的引物 然后调到了载体内部去了
序列比对的时候发现NCBI上面PBI121这个载体有几个修改过的 它们的LB RB是反的 所以我目前把引物反过来设计准备重新调了

有结果了吗?我也是 扩出来的都是载体序列

[ 发自小木虫客户端 ]
15楼2014-03-20 13:25:28
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本田透1990

金虫 (小有名气)

我现在遇到了和你相同的问题,怀疑不止一个T-DNA插入,楼主你的问题解决了吗
16楼2014-07-27 22:07:32
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夜卧听风吹雨

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
11楼: Originally posted by 虫子火箭兵 at 2013-05-10 11:17:21
我目前也遇到了同样的问题,第三轮特异条带大概是3kb,但是没有植物基因组的信息,都是载体信息,也是RB外侧基因,有些文献报道可能是骨架确实是插入到植物染色体中,可以根据已知的序列继续设计引物TAIL,...

你好,请问你后来问题解决了吗?我现在也遇到这个问题,是载体骨架也插入到植物基因组中去了吗?

发自小木虫Android客户端
17楼2017-11-26 11:01:19
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