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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » *.xyz文件import无法进行咋回事
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zergstormor

铜虫 (初入文坛)

[交流] *.xyz文件import无法进行咋回事

在记事本中编辑好了后转换成了*.xyz文件，但是在MS中File→import却打不开，显示出个对话框：The document could not be imported:
The document specified for import doesn't exist.
这是怎么回事呢？方法不对吗？
*.xyz文件的格式是下面这样子的
11241 #原子个数
Atoms
Al 0.000000000 0.000000000 1.154700538  #原子种类 x y z
Al 0.000000000 0.000000000 2.886751346
Al 0.000000000 0.000000000 4.618802154
Al 0.000000000 0.000000000 6.350852961
Al 0.000000000 0.000000000 8.082903769
Al 0.000000000 0.408248290 0.577350269
...
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1楼 2012-04-02 10:16:59
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zergstormor

铜虫 (初入文坛)
有懂的吗？？
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2楼2012-04-02 10:19:24
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lranan

铜虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-04-02 18:45:45
zergstormor: 金币+1, 改了下还是不行但还是谢谢你~ 2012-04-02 20:02:12
可能是保存文件的格式有问题。我们用到的格式是
4800

al   0.000000000000    0.000000000000    7.014805000000
al   2.480110000000    1.431900000000    7.014805000000
al   1.651753260000    0.000000000000    9.353055000000
……
原子个数和坐标和坐标之间有一行空格，就是一个回车键；
不知道能不能帮到你
赞一下 回复此楼
3楼2012-04-02 17:08:32
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dubo

金虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
zh1987hs: 金币+1, thank you 2012-04-02 20:08:10
zergstormor: 金币+1, 你说的放到附件里是什么意思？我是在excel整理好数据，然后放word里编辑好空格什么的，最后放到txt里，然后另存为.xyz格式，有错误码？ 2012-04-02 20:11:20
把你的文件放到附件里吧！
不行的话，9成事你的文件格式不对
赞一下 回复此楼
4楼2012-04-02 19:15:26
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zergstormor

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by lranan at 2012-04-02 17:08:32:
可能是保存文件的格式有问题。我们用到的格式是
4800

al   0.000000000000    0.000000000000    7.014805000000
al   2.480110000000    1.431900000000    7.014805000000
al   1.651753260000    0.0000 ...

你做数据的顺序是什么？我是在excel整理好数据，然后放word里编辑好空格什么的，最后放到txt里，然后另存为.xyz格式，有错误码？
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5楼2012-04-02 20:16:50
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dubo

金虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by zergstormor at 2012-04-02 20:16:50:
你做数据的顺序是什么？我是在excel整理好数据，然后放word里编辑好空格什么的，最后放到txt里，然后另存为.xyz格式，有错误码？

我的意思是你把你生成的文件传上来
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6楼2012-04-02 22:03:51
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phq323

至尊木虫 (职业作家)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-04-05 10:46:47
格式就是这个了。
看看原子个数，是否对应的。
赞一下 回复此楼
7楼2012-04-02 23:32:36
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zergstormor

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by dubo at 2012-04-02 22:03:51:
我的意思是你把你生成的文件传上来

传哪去？
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8楼2012-04-03 16:09:44
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yypcnbe

木虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-04-05 10:46:57
zergstormor: 金币+1 2012-04-05 14:43:43
原子个数后面空一行再输入原子坐标就行了
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9楼2012-04-03 20:42:44
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lranan

铜虫 (小有名气)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-04-05 10:47:03
引用回帖:
5楼: Originally posted by zergstormor at 2012-04-02 20:16:50:
你做数据的顺序是什么？我是在excel整理好数据，然后放word里编辑好空格什么的，最后放到txt里，然后另存为.xyz格式，有错误码？

我们就是直接用C语言，保存.xyz文件
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10楼2012-04-05 09:52:49
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zergstormor

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by phq323 at 2012-04-02 23:32:36:
格式就是这个了。
看看原子个数，是否对应的。

个数对
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11楼2012-04-05 14:43:27
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zergstormor

铜虫 (初入文坛)
★ ★
zh1987hs: 金币+2, thank you 2012-04-05 22:10:44
zergstormor: 回帖置顶 2012-04-06 20:09:56
请教了下老师，需要使用一个VMD文件才可以，把编辑好的*.xyz文件放在VMD子目录下的ilstools1.4里然后就可以在MS中打开了。
赞一下(1人) 回复此楼
12楼2012-04-05 14:53:09
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