| 查看: 821 | 回复: 0 | ||
不喜欢豆芽木虫 (小有名气)
|
[求助]
oniom 分层
|
|
大家好，我想问一下关于oniom计算的几个问题，麻烦大家不吝赐教！ （1）我想用oniom计算小分子与残基的作用，结果小分子与蛋白质有共价键，这个共价键在分层的时候一般要怎么处理呢？可以和残基的一样让GV用氢饱和吗？ （2）还有，看那件manual上说，当两层之间有静电作用时，最好用电荷嵌入，想问一下这个两层只见那怎么才算有静电作用呢？即在什么情况下用电和嵌入呢？ （3）还有，我的一个体系中含有金属钙，而且有共价键，我看了一下amber力场的数据库里只有他的力常数和范德华半径，google了一下，也没有找到，请问大家谁有钙在AMBER力场中的相关参数吗？ |
回复此楼» 猜你喜欢
散金求好运
已经有315人回复
-
博士生招生, 材料模拟方向，University of South Carolina
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有51人回复
-
Postdoc position, materials simulations/machine learning, U. of South Carolina
已经有0人回复
-
祈福青基
已经有34人回复
-
瑞典-博后-固态电池-粘结剂-锂离子电池方向
已经有53人回复
-
牛来！米来！面来！
已经有8人回复
-
广东省面上有什么动态么，啥时候公布呀？
已经有1人回复
-
2027申博咨询
已经有11人回复
-
高盐废水电催化氧化，氯离子存在下活性氯副产物、阳极选型的工程困惑
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
