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liuqun

木虫 (小有名气)

[求助] 电荷密度图

我用lev00做了一下电荷密度图,下面是PT,上面的两个是I,这个图说明什么呢,两个I原子之间还有作用吗?键断了吗?第一次做,不懂,请大家指教一下[ Last edited by liuqun on 2012-3-30 at 17:31 ]
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  • 2012-03-30 17:31:12, 493.68 K

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xueht987

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
sunyang1988: 金币+2, 谢谢交流 2012-04-01 09:24:22
楼主做的是表面吸附吗?
楼主如果想知道两个I原子之间的作用,建议先算一下I2分子的键长或者查一次,然后与吸附后的比较一下,不用这么麻烦。这个呢,也可以看,I原子之间还是有作用的,不过楼主的等高图处理的不太好,建议把图再画的详细一些,这样可以知道跟多细节!
2楼2012-04-01 08:59:47
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cclw

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
franch: 金币+2 2012-04-02 10:00:33
可以粗略看出I原子之间有相互作用的。但是直接做电荷密度图很多细节没有办法显示,建议结合自由的I2分子键长比较,再做个差分电荷密度,可以看出很多信息。
3楼2012-04-01 10:15:00
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liuqun

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by cclw at 2012-04-01 10:15:00:
可以粗略看出I原子之间有相互作用的。但是直接做电荷密度图很多细节没有办法显示,建议结合自由的I2分子键长比较,再做个差分电荷密度,可以看出很多信息。

差分电荷密度怎么做?用什么程序呢?能说明什么问题呢?
4楼2012-04-01 19:37:59
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cclw

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
fzx2008: 金币+1, 谢谢交流! 2012-04-02 15:27:17
用总的电荷密度减去表面体系和自由I2的superposition的电子密度,可以反映I2与表面的相互作用以及自由I2分子吸附引起的电子密度变化。具体做法看vasp说明,主要设置是ICHARG=2,vasp手册有相应参数的意义。

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5楼2012-04-02 15:11:16
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tider

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
WDD880227: 金币+1, 感谢您的耐心回帖~~ 2012-04-06 15:00:05
你的这个图还要做的更精细一些。不过大体看来两个 I 还是成健的。建议你参照侯博士的那个lev00的指导书,修改优化电荷密度的最高显示值和最低显示值,再做一遍。另外你还需要关闭origin中的speed mode,这样图像会更加圆滑。至于差分电荷密度图,我觉得没有必要在做的。
6楼2012-04-06 13:55:12
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tider

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-04-11 08:34:54
不过我觉得你做出两个I 原子的态密度来分析它们的成健会更好。
7楼2012-04-06 13:56:38
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liuqun

木虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by cclw at 2012-04-02 15:11:16:
用总的电荷密度减去表面体系和自由I2的superposition的电子密度,可以反映I2与表面的相互作用以及自由I2分子吸附引起的电子密度变化。具体做法看vasp说明,主要设置是ICHARG=2,vasp手册有相应参数的意义。

怎么看superposition的电子密度呢?从哪个输出文件看?
8楼2012-04-10 20:48:39
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