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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 电荷密度图
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liuqun

木虫 (小有名气)

[求助] 电荷密度图

我用lev00做了一下电荷密度图，下面是PT，上面的两个是I，这个图说明什么呢，两个I原子之间还有作用吗？键断了吗？第一次做，不懂，请大家指教一下[ Last edited by liuqun on 2012-3-30 at 17:31 ]
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    • 2012-03-30 17:31:12, 493.68 K

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1楼 2012-03-30 17:21:27
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xueht987

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
sunyang1988: 金币+2, 谢谢交流 2012-04-01 09:24:22
楼主做的是表面吸附吗？
楼主如果想知道两个I原子之间的作用，建议先算一下I2分子的键长或者查一次，然后与吸附后的比较一下，不用这么麻烦。这个呢，也可以看，I原子之间还是有作用的，不过楼主的等高图处理的不太好，建议把图再画的详细一些，这样可以知道跟多细节！
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2楼2012-04-01 08:59:47
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cclw

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+2 2012-04-02 10:00:33
可以粗略看出I原子之间有相互作用的。但是直接做电荷密度图很多细节没有办法显示，建议结合自由的I2分子键长比较，再做个差分电荷密度，可以看出很多信息。
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3楼2012-04-01 10:15:00
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liuqun

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by cclw at 2012-04-01 10:15:00:
可以粗略看出I原子之间有相互作用的。但是直接做电荷密度图很多细节没有办法显示，建议结合自由的I2分子键长比较，再做个差分电荷密度，可以看出很多信息。

差分电荷密度怎么做？用什么程序呢？能说明什么问题呢？
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4楼2012-04-01 19:37:59
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cclw

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
fzx2008: 金币+1, 谢谢交流！ 2012-04-02 15:27:17
用总的电荷密度减去表面体系和自由I2的superposition的电子密度，可以反映I2与表面的相互作用以及自由I2分子吸附引起的电子密度变化。具体做法看vasp说明，主要设置是ICHARG=2,vasp手册有相应参数的意义。
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liuqun
5楼2012-04-02 15:11:16
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tider

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
WDD880227: 金币+1, 感谢您的耐心回帖~~ 2012-04-06 15:00:05
你的这个图还要做的更精细一些。不过大体看来两个 I 还是成健的。建议你参照侯博士的那个lev00的指导书，修改优化电荷密度的最高显示值和最低显示值，再做一遍。另外你还需要关闭origin中的speed mode，这样图像会更加圆滑。至于差分电荷密度图，我觉得没有必要在做的。
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6楼2012-04-06 13:55:12
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tider

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-04-11 08:34:54
不过我觉得你做出两个I 原子的态密度来分析它们的成健会更好。
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7楼2012-04-06 13:56:38
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liuqun

木虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by cclw at 2012-04-02 15:11:16:
用总的电荷密度减去表面体系和自由I2的superposition的电子密度，可以反映I2与表面的相互作用以及自由I2分子吸附引起的电子密度变化。具体做法看vasp说明，主要设置是ICHARG=2,vasp手册有相应参数的意义。

怎么看superposition的电子密度呢？从哪个输出文件看？
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8楼2012-04-10 20:48:39
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