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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 染料敏化太阳能电池中有机染料分子吸附建模求助
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huangll99

木虫 (职业作家)
引用回帖:
9楼: Originally posted by souledge at 2012-04-28 12:42:46:
对于分子模型，建议LZ使用Gaussian View或者MS建模，非常容易，并且建模后建议用Gaussian或者dmol3进行结构优化（这样就不用担心建模时要关注太多的键长和键角了），优化后，再放到盒子里用VASP优化，然后在给 ...

souledge专家好厉害啊，懂这么多
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11楼2012-04-28 15:56:14
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buct2010

金虫 (正式写手)
送鲜花一朵
谢谢你的帮助，我最近也在学Gaussian，看来有的东西得系统的学习一下，不能一蹴而就啊。
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12楼2012-04-28 18:03:34
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buct2010

金虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
10楼: Originally posted by souledge at 2012-04-28 12:53:40:
刚刚没说清楚，用Gaussian或者dmol3先驰豫的原因是，Gaussian和dmol3都可以做无周期结构的计算，只要分子不是大的吓人的，计算速度是非常非常快的～

谢谢你的帮助，我最近也在学Gaussian，看来有的东西得系统的学习一下，不能一蹴而就啊。
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13楼2012-04-28 18:04:27
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707462558

银虫 (著名写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by souledge at 2012-04-28 12:42:46
对于分子模型，建议LZ使用Gaussian View或者MS建模，非常容易，并且建模后建议用Gaussian或者dmol3进行结构优化（这样就不用担心建模时要关注太多的键长和键角了），优化后，再放到盒子里用VASP优化，然后在给粘 ...

你好  我想问一下您说的‘并且建模后建议用Gaussian或者dmol3进行结构优化（这样就不用担心建模时要关注太多的键长和键角了’直接用vasp优化键长键角会有什么问题吗？我要把一个原子或者原子团吸附到纳米管的表面怎么吸呀   也是拿画笔画吗
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无论生活和你开了多大的玩笑我们都得继续生活
14楼2012-12-29 21:48:27
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lfzlpd

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
14楼: Originally posted by 707462558 at 2012-12-29 21:48:27
你好  我想问一下您说的‘并且建模后建议用Gaussian或者dmol3进行结构优化（这样就不用担心建模时要关注太多的键长和键角了’直接用vasp优化键长键角会有什么问题吗？我要把一个原子或者原子团吸附到纳米管的表面怎 ...

1.直接做周期的，慢呀；
2.将无周期的原子团贴到NT上，再用脚本转成POSCAR
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15楼2013-01-21 02:23:38
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707462558

银虫 (著名写手)
引用回帖:
15楼: Originally posted by lfzlpd at 2013-01-21 02:23:38
1.直接做周期的，慢呀；
2.将无周期的原子团贴到NT上，再用脚本转成POSCAR...

意思是放到盒子里优化就因为有了周期性就变慢了？在domol3里面优化的话不需要放格子里吗
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无论生活和你开了多大的玩笑我们都得继续生活
16楼2013-01-21 10:53:21
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zh11111

银虫 (正式写手)

---
引用回帖:
10楼: Originally posted by souledge at 2012-04-28 12:53:40
刚刚没说清楚，用Gaussian或者dmol3先驰豫的原因是，Gaussian和dmol3都可以做无周期结构的计算，只要分子不是大的吓人的，计算速度是非常非常快的～

请教一下：在dmol3优化分子之前，所建的分子模型结构对优化后的结果有没有关系？换句话说，我开始只知道分子的分子式（并不知道分子内的键长、键角）而手动画出的分子结构经过dmol3优化的结果是否有意义？
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---
17楼2015-07-12 07:59:06
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jiancai1970

新虫 (小有名气)
引用回帖:
11楼: Originally posted by huangll99 at 2012-04-28 15:56:14
souledge专家好厉害啊，懂这么多...

我想请问一下，这个染料分子模型是什么分子，化学式是什么
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18楼2016-09-07 08:29:52
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