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桐叶下飘雨

木虫 (著名写手)

台湾省委副书记、省长江大桥

[求助] 作图时,溶剂分子数目和cif分子量给出的数目不一致,谢谢大家~

在cif文件中 我们通过分子量可以算出 溶剂分子应该是有4个
但是在软件中 打开 grow什么的都使用了 但是只显示2个溶剂分子
事实上
这并不是因为只出现了一半分子
因为主体的配位结构已经完整了
但是就是溶剂分子数目出现问题了

我知道这个问题是可以解决的
但不知道解决方法
谢谢大家啦!~~
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台湾省委副书记、省长江大桥
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irtgea

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
桐叶下飘雨: 金币+2, 谢谢应助!~ 2012-03-25 15:17:46
cif文件中的分子式有时是随便写的,也可能与独立单元是倍数关系,我觉得你应该搞清楚每个独立单元对应的客体数才行
2楼2012-03-25 15:03:03
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桐叶下飘雨

木虫 (著名写手)

台湾省委副书记、省长江大桥

桐叶下飘雨: 回帖置顶 2012-03-25 15:20:10
事实上 解晶体的人曾经给我用cif做出过4个溶剂分子的图
而且4个溶剂分子是真实结构
通过其他表征方法可以证明的确是4个溶剂
但是我就是不会处理...
郁闷
台湾省委副书记、省长江大桥
3楼2012-03-25 15:20:02
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yunruirui

荣誉版主 (著名写手)

云朵爸

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
桐叶下飘雨: 金币+2, O(∩_∩)O谢谢~ 2012-03-25 16:24:35
在晶体解析完毕后,看lst文件中分子式,然后在看独立单元中分子数,在确定Z值,结果就很明显了
4楼2012-03-25 15:45:16
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r2rr2r

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
桐叶下飘雨: 金币+4, 有帮助, xp-- fmol/n-- kill$q $h-- sgen-- 很郁闷的是 接着就显示 bad sgen instruction... 呵呵 不能用啊这个命令... 2012-03-26 09:56:29
桐叶下飘雨: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 果然,3Q~ 2012-03-27 09:20:12
grow的时候,孤立的溶剂分子并不会随着主结构加倍。
如要弄出来,可以不用grow,而用是sgen来长全主结构,这样溶剂就会随之加倍
5楼2012-03-25 18:37:27
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mashulin

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
桐叶下飘雨: 金币+2, 谢谢 2012-03-26 09:53:11
grow的时候,孤立的溶剂分子并不会随着主结构加倍。只要lis文件中分子数和cif文件中分子数一致,就能确认客体分子数。
6楼2012-03-26 07:04:15
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桐叶下飘雨

木虫 (著名写手)

台湾省委副书记、省长江大桥

sgen 1555 C19 C20 O3 O4
台湾省委副书记、省长江大桥
7楼2012-03-27 09:22:22
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