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gmy1990

荣誉版主 (著名写手)

[交流] 量子化学版FAQ更新，问题征集！

量子化学版块最近准备对FAQ进行更新，大家有什么问题，以及好的建议积极留言。 老版FAQ停止更新了http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1566146. 新版FAQ将由版块专家版主协力完成编辑工作，大家集思广益，争取打造成量化新手入门必读经典.


刷帖得金币的请绕道，把金币留给留下好的意见和建议的人，违反者一律罚至少5金币，想挑战的就来.，算是给这个交流贴提高悬赏金币了




[ Last edited by gmy1990 on 2012-3-22 at 23:04 ]
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1楼 2012-03-20 20:16:07
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schalke

至尊木虫 (著名写手)
★
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
双分子体系的初始构象摆放，优化，最好是做几种模型反应的计算过程的演示动画。
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6楼2012-03-22 12:08:16
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
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loovfnd

至尊木虫 (著名写手)
★
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
高斯中吉布斯自由能和活化能怎么计算呢？
赞一下 回复此楼
2楼2012-03-21 10:22:55
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muxiachuixue

木虫 (正式写手)
★ ★
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
gmy1990: 金币+1, 好的，谢谢你的建议，不过还得耐心等待段时间了，貌似大家都没什么问题，哈哈 2012-03-21 22:17:11
希望各位版主讲一下以下几方面
1. 如何进行一维和二维势能面扫描（包括软扫和硬扫），我用modredundant来软扫的时候，如果同时固定原子，就会出错。势能面扫描在计算过渡态的时候可能比较有用，希望大侠们不吝传授
2. 过渡态计算策略能否讲的详细一点，曾经在版上看到过一篇帖子，写如何找过渡态的，写的很好，好像是zhou斑竹的，希望能放进FAQ~
3. 对大体系的处理，比如酶蛋白，在用oniom的时候有什么经验和注意事项
4. 能否讲一下输出文件中每部分大概是什么意思？另外我想知道job cpu time 和真实时间到底有什么换算关系
5.能否说一下大家在计算中碰到过什么问题，后来是怎么解决的？
呵呵，小弟接触高斯几个月，问的太肤浅，希望斑竹不要见怪哈~
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3楼2012-03-21 21:49:16
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muxiachuixue

木虫 (正式写手)
★
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
顶一下，顺便抢一下金币，哈哈
赞一下 回复此楼
4楼2012-03-21 21:51:06
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