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gmy1990

荣誉版主 (著名写手)

[交流] 量子化学版FAQ更新，问题征集！

量子化学版块最近准备对FAQ进行更新，大家有什么问题，以及好的建议积极留言。 老版FAQ停止更新了http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1566146. 新版FAQ将由版块专家版主协力完成编辑工作，大家集思广益，争取打造成量化新手入门必读经典.


刷帖得金币的请绕道，把金币留给留下好的意见和建议的人，违反者一律罚至少5金币，想挑战的就来.，算是给这个交流贴提高悬赏金币了




[ Last edited by gmy1990 on 2012-3-22 at 23:04 ]
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1楼 2012-03-20 20:16:07
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loovfnd

至尊木虫 (著名写手)
★
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
高斯中吉布斯自由能和活化能怎么计算呢？
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2楼2012-03-21 10:22:55
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muxiachuixue

木虫 (正式写手)
★ ★
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
gmy1990: 金币+1, 好的，谢谢你的建议，不过还得耐心等待段时间了，貌似大家都没什么问题，哈哈 2012-03-21 22:17:11
希望各位版主讲一下以下几方面
1. 如何进行一维和二维势能面扫描（包括软扫和硬扫），我用modredundant来软扫的时候，如果同时固定原子，就会出错。势能面扫描在计算过渡态的时候可能比较有用，希望大侠们不吝传授
2. 过渡态计算策略能否讲的详细一点，曾经在版上看到过一篇帖子，写如何找过渡态的，写的很好，好像是zhou斑竹的，希望能放进FAQ~
3. 对大体系的处理，比如酶蛋白，在用oniom的时候有什么经验和注意事项
4. 能否讲一下输出文件中每部分大概是什么意思？另外我想知道job cpu time 和真实时间到底有什么换算关系
5.能否说一下大家在计算中碰到过什么问题，后来是怎么解决的？
呵呵，小弟接触高斯几个月，问的太肤浅，希望斑竹不要见怪哈~
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3楼2012-03-21 21:49:16
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muxiachuixue

木虫 (正式写手)
★
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
顶一下，顺便抢一下金币，哈哈
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4楼2012-03-21 21:51:06
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songzhengen

金虫 (小有名气)
★
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
给一个详细的完整的计算过程，然初学者照着就能操作
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5楼2012-03-22 11:54:27
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schalke

至尊木虫 (著名写手)
★
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
双分子体系的初始构象摆放，优化，最好是做几种模型反应的计算过程的演示动画。
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6楼2012-03-22 12:08:16
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beipiao616

金虫 (小有名气)
★
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
请各位版主讲一下溶剂化模型那一块儿：
1、不同的溶剂化模型有什么适用范围吗？
2、溶剂化模型提到的集中半径UFF、UAHF、UAO、Bondi等有什么区别吗？
谢谢。
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13楼2012-03-22 15:22:40
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见证2011

至尊木虫 (文坛精英)
★ ★ ★ ★
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
小红豆: 金币-5, 刷屏扣除 2012-03-23 22:30:14
顶一个啊
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16楼2012-03-22 15:48:04
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lblwsj

铁杆木虫 (著名写手)
★
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
不能设置成回复就奖金币，这样子会有n多层的表情
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20楼2012-03-22 17:26:22
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)
★
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
5楼: Originally posted by songzhengen at 2012-03-22 11:54:27:
给一个详细的完整的计算过程，然初学者照着就能操作

此建议拒绝接受
原因见老版的FAQ的序言
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27楼2012-03-22 17:40:49
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)
★
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
3楼: Originally posted by muxiachuixue at 2012-03-21 21:49:16:
希望各位版主讲一下以下几方面
1. 如何进行一维和二维势能面扫描（包括软扫和硬扫），我用modredundant来软扫的时候，如果同时固定原子，就会出错。势能面扫描在计算过渡态的时候可能比较有用，希望大侠们不吝传 ...

这个建议很不错。我们会仔细考虑，尽量将您的意见完整解释出来
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28楼2012-03-22 17:41:35
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)
★
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
6楼: Originally posted by schalke at 2012-03-22 12:08:16:
双分子体系的初始构象摆放，优化，最好是做几种模型反应的计算过程的演示动画。

这个建议很不错。我们会仔细考虑，尽量将您的意见完整解释出来，其实我以前就特别喜欢做视频教程
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29楼2012-03-22 17:43:21
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)
★
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
13楼: Originally posted by beipiao616 at 2012-03-22 15:22:40:
请各位版主讲一下溶剂化模型那一块儿：
1、不同的溶剂化模型有什么适用范围吗？
2、溶剂化模型提到的集中半径UFF、UAHF、UAO、Bondi等有什么区别吗？
谢谢。

这个建议很不错。我们会仔细考虑，尽量将您的意见完整解释出来
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30楼2012-03-22 17:44:12
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)
★
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
20楼: Originally posted by lblwsj at 2012-03-22 17:26:22:
不能设置成回复就奖金币，这样子会有n多层的表情

爱表就表
反正量化版金币库很满
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31楼2012-03-22 17:44:55
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liyuwei

木虫 (知名作家)
★ ★ ★ ★
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
小红豆: 金币-5, 刷屏扣除 2012-03-23 22:37:36
多来了几次哈哈！！！
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42楼2012-03-22 18:02:37
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ylyao

至尊木虫 (文坛精英)
★
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
小红豆: 违规存档 2012-03-23 22:41:15
常来
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49楼2012-03-22 18:08:35
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简单回复
lsyzlp7楼
2012-03-22 12:27  
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
顶一下
haoqi0078楼
2012-03-22 12:38  
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
haoqi0079楼
2012-03-22 12:38  
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
小红豆: 金币-5, 刷屏扣除 2012-03-23 22:27:56
haoqi00710楼
2012-03-22 12:38  
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
小红豆: 金币-5, 违规存档, 刷屏扣除 2012-03-23 22:28:16
haoqi00711楼
2012-03-22 12:38  
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
小红豆: 金币-5, 退还金币 2012-03-23 22:29:15
haoqi00712楼
2012-03-22 12:38  
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
小红豆: 金币-5, 刷屏扣除 2012-03-23 22:29:36
见证201114楼
2012-03-22 15:47  
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
见证201115楼
2012-03-22 15:47  
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
小红豆: 金币-5, 违规存档, 刷屏扣除 2012-03-23 22:30:00
见证201117楼
2012-03-22 15:48  
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
小红豆: 金币-5, 刷屏扣除 2012-03-23 22:30:28
见证201118楼
2012-03-22 15:48  
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
小红豆: 金币-5, 违规存档, 刷屏扣除 2012-03-23 22:30:44
素逸19楼
2012-03-22 17:07  
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
wangwang198921楼
2012-03-22 17:30  
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
小红豆: 金币-5, 违规存档 2012-03-23 22:31:05
wangwang198922楼
2012-03-22 17:30  
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
小红豆: 金币-5, 违规存档 2012-03-23 22:31:14
wangwang198923楼
2012-03-22 17:31  
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
小红豆: 金币-5, 刷屏扣除 2012-03-23 22:31:32
wangwang198924楼
2012-03-22 17:31  
gmy1990(金币+1): 谢谢参与
小红豆: 金币-5, 违规存档 2012-03-23 22:31:39
wangwang198925楼
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gmy1990(金币+1): 谢谢参与
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wangwang198926楼
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小红豆: 金币-5, 刷屏扣除 2012-03-23 22:32:07
liyuwei32楼
2012-03-22 17:48  
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wangbiao939933楼
2012-03-22 17:56  
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hls8591534楼
2012-03-22 17:57  
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祝福
cyjlu35楼
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2012-03-22 18:01  
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cyjlu37楼
2012-03-22 18:01  
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小红豆: 金币-5, 违规存档 2012-03-23 22:33:43
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liyuwei39楼
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cyjlu40楼
2012-03-22 18:02  
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liyuwei43楼
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zy82082445楼
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ylyao46楼
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ylyao48楼
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小红豆: 违规存档 2012-03-23 22:40:44
ylyao50楼
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