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dxjdmy

木虫 (正式写手)

[求助] IRC问题

本人在做机理研究时,自己猜测了中间体,然后运用TS方法求出了过渡态,走IRC得到的构型优化后与所猜测的中间体不一样,这种情况下应该怎么选择中间体?选择走IRC并且优化后的构型作为中间体吗?
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ldzh0531

木虫 (小有名气)

★ ★ ★
小红豆: 金币+3, 3X 2012-03-25 10:25:24
引用回帖:
4楼: Originally posted by dreamyeye at 2012-03-18 18:53:16:
IRC还是比较可靠的吧,你用TS方法得到的过渡态是通过什么判断是你想要的过渡态的?

中间体不是乱猜的。IRC跑出来的结构不是有两个吗,你想验证其中一个是不是想要的中间体,就要看一下IRC跑出来的另一个结构是不是与已知结构一样。一样的话就说明你找的过渡态是对的,那么跑出来的中间体就是要找的。
6楼2012-03-19 12:15:02
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dreamyeye

木虫 (著名写手)

两个中间体差别多大
2楼2012-03-17 18:27:43
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dxjdmy

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by dreamyeye at 2012-03-17 18:27:43:
两个中间体差别多大

差别挺大的,
3楼2012-03-18 12:27:18
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dreamyeye

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
小红豆: 金币+3, 3x 2012-03-25 10:24:15
引用回帖:
3楼: Originally posted by dxjdmy at 2012-03-18 12:27:18:
差别挺大的,

IRC还是比较可靠的吧,你用TS方法得到的过渡态是通过什么判断是你想要的过渡态的?
4楼2012-03-18 18:53:16
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