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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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Nocturne

兑换贵宾

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[求助] 怎样才使苯环上的6个原子在一个平面上?

最近精修结果,苯环上的6个C不在一个平面上
有什么命令才使其在一个平面上呢?
我用了 difix 1.43 0.02 C1 C2
作用不大,用强制角度的命令么?
谢谢!!
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Nocturne(金币+3): ★★★很有帮助 2012-03-09 05:51:00
用afix 66命令,具体如下:
afix 66
c1
c2
c3
c4
c5
c6
afix 0
退思补过
2楼2012-03-08 19:48:36
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p452_1

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【答案】应助回帖

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lichun1210(金币+1): 感谢回帖交流~ 2012-03-09 07:05:33
Nocturne(金币+2): ★★★很有帮助 2012-03-09 20:59:09
可以使用flat指令,使得指定的原子在一个平面上,一般误差为0.1埃。
一般可以写为:
flat 0.1  C1 C2 C3 C4 C5 C6

这样精修后,这6个碳原子就在一个平面上了。
老歪博
3楼2012-03-09 06:53:47
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