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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 怎样才使苯环上的6个原子在一个平面上？
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Nocturne

木虫 (正式写手)

[求助] 怎样才使苯环上的6个原子在一个平面上？

最近精修结果，苯环上的6个C不在一个平面上
有什么命令才使其在一个平面上呢？
我用了 difix 1.43 0.02 C1 C2
作用不大，用强制角度的命令么？
谢谢！！
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1楼 2012-03-08 17:29:48
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pop-popy

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
Nocturne(金币+3): ★★★很有帮助 2012-03-09 05:51:00
用afix 66命令，具体如下：
afix 66
c1
c2
c3
c4
c5
c6
afix 0
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退思补过
2楼2012-03-08 19:48:36
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p452_1

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lichun1210(金币+1): 感谢回帖交流~ 2012-03-09 07:05:33
Nocturne(金币+2): ★★★很有帮助 2012-03-09 20:59:09
可以使用flat指令，使得指定的原子在一个平面上，一般误差为0.1埃。
一般可以写为：
flat 0.1  C1 C2 C3 C4 C5 C6

这样精修后，这6个碳原子就在一个平面上了。
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老歪博
3楼2012-03-09 06:53:47
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