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fly_elephan

银虫 (小有名气)

[求助] vasp计算能带,刚开始就服务器就卡了 已有1人参与

如题,本人用的是联想服务器,16核,内存12G,虚拟内存24G,vasp并行计算一个53原子的体系,刚开始cpu效率逐渐上升至96%左右,接着有点卡,top命令查看内存12G已经用得差不多只剩300M了,然后cpu利用率只有0.3%了。之前算过52个原子的体系,用一个周也可以算完,但这次53个原子的体系却几近死机,请高手分析一下原因。
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snow0804

金虫 (小有名气)

引用回帖:
19楼: Originally posted by 贺仪 at 2014-07-08 11:14:53
你试试就知道了,没啥问题的...

您好,我还有个问题想要问您 , 我在计算的过程中也出现了一个 您曾经参与讨论的问题, 我在两台机器上运行 vasp时 5个原子  截断能小的时候可以计算没有任何问题, 可是一旦阶段能大了   就会出现以下问题
[proxy:0:0@node002] HYD_pmcd_pmip_control_cmd_cb (./pm/pmiserv/pmip_cb.c:886): assert (!closed) failed
[proxy:0:0@node002] HYDT_dmxu_poll_wait_for_event (./tools/demux/demux_poll.c:77): callback returned error status
[proxy:0:0@node002] main (./pm/pmiserv/pmip.c:206): demux engine error waiting for event
[mpiexec@node002] HYDT_bscu_wait_for_completion (./tools/bootstrap/utils/bscu_wait.c:76): one of the processes terminated badly; aborting
[mpiexec@node002] HYDT_bsci_wait_for_completion (./tools/bootstrap/src/bsci_wait.c:23): launcher returned error waiting for completion
[mpiexec@node002] HYD_pmci_wait_for_completion (./pm/pmiserv/pmiserv_pmci.c:217): launcher returned error waiting for completion
[mpiexec@node002] main (./ui/mpich/mpiexec.c:331): process manager error waiting for completion
您知道怎么解决么 ,  谢谢您了
21楼2014-07-08 15:41:28
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liliangfang

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感谢参与,应助指数 +1
fzx2008(金币+1): 谢谢交流! 2012-03-06 22:28:39
呵呵物理内存不够哦
2楼2012-03-06 22:26:17
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fzx2008

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liliangfang(金币+2): 多谢指教 2012-03-07 08:43:14
不光是比原子个数,更重要的是电子个数!
3楼2012-03-06 23:07:18
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fly_elephan

银虫 (小有名气)

感谢提示我把自旋去掉看一看速度如何?
4楼2012-03-07 20:31:14
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