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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 酶蛋白同源建模后模型自带配体，是否还需要做对接？？？
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870609

金虫 (小有名气)

[交流] 酶蛋白同源建模后模型自带配体，是否还需要做对接？？？

rt，我在做酶蛋白同源建模的时候，由于所用的模板带有我所需要的小分子配体，所以在建模的时候选择了将模板中的配体同步到我的模型中（copy ligand 选项），现在的问题是这样未经对接计算一步直接获得大分子与小分子相互作用的模型是否可信，发文章的话是否具有说服力？？？欢迎各位指点，谢谢
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1楼 2012-03-05 08:37:51
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houxuben

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
870609(金币+2): 谢谢指点 2012-03-05 15:04:28
不可信，不同的蛋白跟同一个配体结合模式很难一样的，跑个动力学吧
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2楼2012-03-05 11:30:16
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