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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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crazytea

铜虫 (小有名气)

[求助] 求助diamond画分子筛

我想用diamond软件画NaA(LTA)分子筛,用到论文里。而且已经在iza-structure网站下载了它的cif文件,我按照教程导入后,为什么只出现Si原子而没有Al原子呢?不是应该Si/Al这样子的吗?请问有哪位大侠之前画过吗?
还有弱弱的问一句,chemoffice可以画吗,我之前只用它画过有机分子,不知道无机的可不可以。
望各位大侠解答,不胜感激~
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勤能补拙
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gyliu

铁杆木虫 (职业作家)


lijunjie84(金币+1): 欢迎回帖交流! 2012-03-02 16:39:29
你的cif文件中有Al原子吗?
2楼2012-03-02 14:05:52
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普通回帖

crazytea

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by gyliu at 2012-03-02 14:05:52:
你的cif文件中有Al原子吗?

这我不知道哦,我是从国际网站上下的。cif文件能打开吗,我电脑识别不了啊,只能导入。
勤能补拙
3楼2012-03-02 22:00:02
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gouyi

金虫 (正式写手)

sanchuanok

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
crazytea(金币+7): ★★★很有帮助 确实没有Al原子,多谢指教~ 2012-03-03 00:43:02
lichun1210(金币+1): 鼓励回帖交流~ 2012-03-03 08:00:28
你用txt格式打开看看里面有没有AL原子,如果有的话,可能是Al原子没有与你插入的原子成键,可以通过插入Al
生命不止,奋斗不息;天赋人责,舍我其谁!
4楼2012-03-02 22:27:10
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crazytea

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by gouyi at 2012-03-02 22:27:10:
你用txt格式打开看看里面有没有AL原子,如果有的话,可能是Al原子没有与你插入的原子成键,可以通过插入Al

怎么插入Al啊,恳请赐教。ps:可不可以在txt格式下改cif文件啊。我第一次画分子筛,本以为导入就完事了的,没想到这么复杂。。。
勤能补拙
5楼2012-03-03 00:47:54
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gouyi

金虫 (正式写手)

sanchuanok


huangjr(金币+1): 感谢回帖交流~ 2012-03-04 08:47:33
引用回帖:
5楼: Originally posted by crazytea at 2012-03-03 00:47:54:
怎么插入Al啊,恳请赐教。ps:可不可以在txt格式下改cif文件啊。我第一次画分子筛,本以为导入就完事了的,没想到这么复杂。。。

改是可以改,但是很复杂,你不好确定他们的坐标啊,如果你知道他们的坐标,可以直接在diamond中通过添加哑原子的方式插入,不过建议从新下载一个完整的cif文件,
生命不止,奋斗不息;天赋人责,舍我其谁!
6楼2012-03-03 14:44:20
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crazytea

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by crazytea at 2012-03-03 00:47:54:
怎么插入Al啊,恳请赐教。ps:可不可以在txt格式下改cif文件啊。我第一次画分子筛,本以为导入就完事了的,没想到这么复杂。。。

我那个就是在国际分子筛网站上下载的,我不知道哪还有下载,你还有什么其他推荐下载的地方吗?
勤能补拙
7楼2012-03-04 01:04:07
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gouyi

金虫 (正式写手)

sanchuanok

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
crazytea(金币+7): ★★★很有帮助 我已经在下了,好像文件挺大的,谢谢你啊,有啥不懂的还要请教~ 2012-03-05 00:19:27
linhua0402313: 金币+1, 感谢回帖交流! 2012-04-13 08:57:52
引用回帖:
7楼: Originally posted by crazytea at 2012-03-04 01:04:07:
我那个就是在国际分子筛网站上下载的,我不知道哪还有下载,你还有什么其他推荐下载的地方吗?

有一个无机的数据库ISCD,很有用的,里面应该有你要的结构。你可以下载安装一个,网上有很多
生命不止,奋斗不息;天赋人责,舍我其谁!
8楼2012-03-04 12:07:43
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calebby

捐助贵宾 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
crazytea: 金币+6, 有帮助, 首先感谢你应助,不过diamond使用手册里给出的例子是FAU八面沸石的,跟LTA还有一些不一样,主要是参数方面,可这些参数需要怎么更改呢?您那有具体画A型分子筛的教程吗,或者就您所知,从哪能获得相关的参数呢? 2012-04-12 00:00:21
linhua0402313: 金币+2, 感谢回帖交流!希望对楼主有帮助 2012-04-13 08:58:07
那个网站上给出的cif文件里面给的是T原子,而T原子就是指的Si/Al .
在diamond的使用手册里就有一个例子是画沸石分子筛的,你可以按照它的方法来,很简单的。  chemoffice似乎不能画出这样复杂的图来。
9楼2012-04-10 19:48:09
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calebby

捐助贵宾 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
crazytea: 金币+10, ★★★很有帮助, 我试过了,FAU完全根据教程是可以画出来的,而且一模一样。但是LTA肯定全部根据教程处理是画不出来的,我也试过了。因为我是初学者,之前没有接触过,所以很多问题在您看来或许很幼稚。比如,LTA需要画哑原子吗,需要添加多面体吗,需要X、Y、Z轴旋转吗?因为毕竟FAU跟LTA形状差距还是很大的。ps:你之前画过的话可以传给我看看吗?不胜感激啊~ 2012-04-13 00:06:56
linhua0402313: 金币+1, 感谢回帖交流! 2012-04-13 08:58:25
LTA和FAU的画法完全一样,也是把Si-Si 键长设置为3~3.5A,取消Si-O键,再让它长,就可以得到LTA拓扑了。你也可以像教程里那样,插入dummy原子,再add polyhedron,画出的图很好看的。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

10楼2012-04-12 08:12:46
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