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crazytea

铜虫 (小有名气)

[求助] 求助diamond画分子筛

我想用diamond软件画NaA（LTA）分子筛，用到论文里。而且已经在iza-structure网站下载了它的cif文件，我按照教程导入后，为什么只出现Si原子而没有Al原子呢？不是应该Si/Al这样子的吗？请问有哪位大侠之前画过吗？
还有弱弱的问一句，chemoffice可以画吗，我之前只用它画过有机分子，不知道无机的可不可以。
望各位大侠解答，不胜感激~
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勤能补拙
1楼2012-03-02 12:15:50
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gyliu

铁杆木虫 (职业作家)
★
lijunjie84(金币+1): 欢迎回帖交流！ 2012-03-02 16:39:29
你的cif文件中有Al原子吗？
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2楼2012-03-02 14:05:52
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普通回帖

crazytea

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
楼: Originally posted by gyliu at 2012-03-02 14:05:52:
你的cif文件中有Al原子吗？

这我不知道哦，我是从国际网站上下的。cif文件能打开吗，我电脑识别不了啊，只能导入。
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勤能补拙
3楼2012-03-02 22:00:02
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gouyi

金虫 (正式写手)

sanchuanok

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
crazytea(金币+7): ★★★很有帮助 确实没有Al原子，多谢指教~ 2012-03-03 00:43:02
lichun1210(金币+1): 鼓励回帖交流~ 2012-03-03 08:00:28
你用txt格式打开看看里面有没有AL原子，如果有的话，可能是Al原子没有与你插入的原子成键，可以通过插入Al
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4楼2012-03-02 22:27:10
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crazytea

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
楼: Originally posted by gouyi at 2012-03-02 22:27:10:
你用txt格式打开看看里面有没有AL原子，如果有的话，可能是Al原子没有与你插入的原子成键，可以通过插入Al

怎么插入Al啊，恳请赐教。ps:可不可以在txt格式下改cif文件啊。我第一次画分子筛，本以为导入就完事了的，没想到这么复杂。。。
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勤能补拙
5楼2012-03-03 00:47:54
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gouyi

金虫 (正式写手)

sanchuanok
★
huangjr(金币+1): 感谢回帖交流~ 2012-03-04 08:47:33
引用回帖:
5楼: Originally posted by crazytea at 2012-03-03 00:47:54:
怎么插入Al啊，恳请赐教。ps:可不可以在txt格式下改cif文件啊。我第一次画分子筛，本以为导入就完事了的，没想到这么复杂。。。

改是可以改，但是很复杂，你不好确定他们的坐标啊，如果你知道他们的坐标，可以直接在diamond中通过添加哑原子的方式插入，不过建议从新下载一个完整的cif文件，
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6楼2012-03-03 14:44:20
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crazytea

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by crazytea at 2012-03-03 00:47:54:
怎么插入Al啊，恳请赐教。ps:可不可以在txt格式下改cif文件啊。我第一次画分子筛，本以为导入就完事了的，没想到这么复杂。。。

我那个就是在国际分子筛网站上下载的，我不知道哪还有下载，你还有什么其他推荐下载的地方吗？
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勤能补拙
7楼2012-03-04 01:04:07
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gouyi

金虫 (正式写手)

sanchuanok

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
crazytea(金币+7): ★★★很有帮助 我已经在下了，好像文件挺大的，谢谢你啊，有啥不懂的还要请教~ 2012-03-05 00:19:27
linhua0402313: 金币+1, 感谢回帖交流！ 2012-04-13 08:57:52
引用回帖:
7楼: Originally posted by crazytea at 2012-03-04 01:04:07:
我那个就是在国际分子筛网站上下载的，我不知道哪还有下载，你还有什么其他推荐下载的地方吗？

有一个无机的数据库ISCD，很有用的，里面应该有你要的结构。你可以下载安装一个，网上有很多
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8楼2012-03-04 12:07:43
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calebby

捐助贵宾 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
crazytea: 金币+6, ★有帮助, 首先感谢你应助，不过diamond使用手册里给出的例子是FAU八面沸石的，跟LTA还有一些不一样，主要是参数方面，可这些参数需要怎么更改呢？您那有具体画A型分子筛的教程吗，或者就您所知，从哪能获得相关的参数呢？ 2012-04-12 00:00:21
linhua0402313: 金币+2, 感谢回帖交流！希望对楼主有帮助 2012-04-13 08:58:07
那个网站上给出的cif文件里面给的是T原子，而T原子就是指的Si/Al .
在diamond的使用手册里就有一个例子是画沸石分子筛的，你可以按照它的方法来，很简单的。  chemoffice似乎不能画出这样复杂的图来。
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9楼2012-04-10 19:48:09
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calebby

捐助贵宾 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
crazytea: 金币+10, ★★★很有帮助, 我试过了，FAU完全根据教程是可以画出来的，而且一模一样。但是LTA肯定全部根据教程处理是画不出来的，我也试过了。因为我是初学者，之前没有接触过，所以很多问题在您看来或许很幼稚。比如，LTA需要画哑原子吗，需要添加多面体吗，需要X、Y、Z轴旋转吗？因为毕竟FAU跟LTA形状差距还是很大的。ps:你之前画过的话可以传给我看看吗？不胜感激啊~ 2012-04-13 00:06:56
linhua0402313: 金币+1, 感谢回帖交流！ 2012-04-13 08:58:25
LTA和FAU的画法完全一样，也是把Si-Si 键长设置为3~3.5A,取消Si-O键，再让它长，就可以得到LTA拓扑了。你也可以像教程里那样，插入dummy原子，再add polyhedron，画出的图很好看的。
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crazytea
10楼2012-04-12 08:12:46
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