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Gamess 能量分解的输入文件
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| 各位大虾,本人想用Gamess做一个二聚体的能量分解,由于没有接触过此软件,不知如何编写输入文件,还有能量分解的方法也不了解,请大家赐教,在此急求能量分解的输入文件和输出文件的例子,及能量分解方法的种类和选取办法 |
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【答案】应助回帖
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不清楚你体系是什么……我在这里给一个用LMOEDA做能量分解的例子: $contrl scftyp=rhf runtyp=eda dfttyp=b3lyp1 $end $contrl icharg=1 mult=1 ispher=1 $end $lmoeda matom(1)=9 1 mcharg(1)=0 1 mmult(1)=1 1 supbas=.t. $end $basis gbasis=cct $end $pcm solvnt=water $end $pcmcav alpha=1.1 $end $pcmcav rin(1)=1.926 rin(2)=2.018 rin(3)=1.926 rin(4)=1.443 $end $pcmcav rin(5)=1.443 rin(6)=1.443 rin(7)=1.443 rin(8)=1.443 $end $pcmcav rin(9)=1.443 rin(10)=1.748 $end $tescav ntsall=240 mthall=4 $end $scf diis=.t. soscf=.f. dirscf=.t. fdiff=.f. npunch=1 ethrsh=100 $end $system mwords=100 memddi=600 $end $data itle: 1 C 6.0 10.1942801565 48.6863306161 32.3481462225 S 16.0 10.3578593780 50.3645238138 33.0032994531 C 6.0 8.7849632260 51.0813218166 32.4700178815 H 1.0 9.3667191827 48.2198062710 32.8775002151 H 1.0 11.1144700756 48.1540385817 32.5734553514 H 1.0 8.6596670994 50.9919698765 31.3954506977 H 1.0 7.9988865414 50.5450972368 32.9965472141 H 1.0 8.7786391502 52.1244074795 32.7745939847 H 1.0 10.0084600746 48.7010866606 31.2787325421 CU 29.0 11.9147019946 51.3366703824 31.8673297512 $end 先回,下面解释参数 |
2楼2012-07-15 19:29:00
slay3: 回帖置顶 2012-09-14 13:53:05
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上面的例子是比较复杂的,考虑的PCM效应的,现在GAMESS官方程序中还没有,我们老板刚开发完(相应文章已被JCP接收)。所以你计算的时候不需要$PCM和$PCMCAV参数。 最为重要的是$CONTRL中的 runtyp=eda,用于说明你是进行EDA(能量分解)计算 然后是 $LMOEDA, 这一项用于设定EDA相应的参数: matom(1)=9 1 说明将下面的体系分为两个block,前一个block包含9个原子(前9个);后一个block包含一个原子(即Cu),计算这两个block间的相互作用能,并进行分解。需要注意的是一定不能让block间的原子交错。不错结果一定是错的。 mcharg(1)=0 1 用于定义两个block所带的电荷。此例子中,第一个不带电,第二个CU为+1价; mmult(1)=1 1 定义两个block的多重度。此例子中两个BLOCK均为闭壳层,所以设定为1。 supbas=.t. 进行BSSE消除计算,这个默认选项,可以不写。 其它的一此参数与$BASIS, $SCF, SSYSTEM都是根据实际需要调整的 |
3楼2012-07-15 19:41:17











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