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sunwujin2006铁杆木虫 (小有名气)
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[求助]
Discovery studio2.5 中ZDOCK 对接的蛋白总是叠合在一起
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小弟对于模拟是新手，恳请各位大侠指教 最近要模拟一个蛋白，文献中描述是四聚体，而其模板pdb code： 1S1M 只给出了二聚体，其它更接近的模板最多就是二聚体。没有搜到类似的四聚体模板来superimpose出四聚体的结构。 由于文献中描述了四聚体的结合位点，我就尝试用DS2.5中的Zdock来对接两个二聚体。而Zdock的结果总是将两个蛋白叠合在一起，而不是对接起来。我再尝试其他一些小的蛋白，结果也是叠合起来了。 我的DS2.5是在电驴上下的，不是正版的 不知道有没有人遇到过类似的情况，还请多多指教，谢谢！ |
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2楼2021-04-23 11:47:40