| 查看: 1537 | 回复: 1 | ||
sunwujin2006铁杆木虫 (小有名气)
|
[求助]
Discovery studio2.5 中ZDOCK 对接的蛋白总是叠合在一起
|
|
小弟对于模拟是新手，恳请各位大侠指教 最近要模拟一个蛋白，文献中描述是四聚体，而其模板pdb code： 1S1M 只给出了二聚体，其它更接近的模板最多就是二聚体。没有搜到类似的四聚体模板来superimpose出四聚体的结构。 由于文献中描述了四聚体的结合位点，我就尝试用DS2.5中的Zdock来对接两个二聚体。而Zdock的结果总是将两个蛋白叠合在一起，而不是对接起来。我再尝试其他一些小的蛋白，结果也是叠合起来了。 我的DS2.5是在电驴上下的，不是正版的 不知道有没有人遇到过类似的情况，还请多多指教，谢谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
一个有机合成实验室都需要哪些设备？
已经有7人回复
-
2026年国自然面上资助率
已经有20人回复
-
面上再次挂了，太难了，躺也躺不了，倦也卷不过，小学校之殇！
已经有22人回复
-
微信指数没变化，科研之友没阅读
已经有18人回复
-
基础研究怎么拉横向，学校到款任务越来越多，难以完成 拉横向，都有哪些途径啊
已经有8人回复
-
HXDI做水性聚氨酯乳液，是不是特别容易出渣
已经有3人回复
-
系统今天又提示维护了，估计离放榜不远了
已经有15人回复
-
你们的时间戳变了吗
已经有4人回复
-
产物和副产物价值比较
已经有5人回复
-
时间戳他又来了
已经有17人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Autodock对接构象准确性的评价——RMSD
已经有10人回复
- 求助Discovery Studio 或其他蛋白质建模软件 软件
已经有7人回复
- 求Discovery studio V2.5.ISO 在fedora 15下的安装步骤
已经有6人回复
- 【求助】计算机辅助药物设计
已经有9人回复
- 【原创】Accelry discovery studio 2.5
已经有9人回复
|
本帖内容被屏蔽 |
2楼2021-04-23 11:47:40