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wang-yuan

新虫 (初入文坛)

[求助] 多肽化合物的docking

大家做过多肽的docking吗?我想请教大家一下用什么软件,怎么做的.我目前
用的是Moe软件,在能量优化及构象搜索后,发现多肽的构象不对.谢谢大家了.
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wang-yuan

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
: Originally posted by huanghl2010 at 2012-02-23 08:26:39:
请问docking是什么意思?不好意思,是我小白。

嘿嘿,是生物大分子与相应的配体对接的意思
6楼2012-02-23 10:25:00
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leo1252

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
chaizhm(金币+2): 谢谢~ 2012-02-21 19:56:13
你的多肽大小是多少啊,如果残基较少,可以选用普通的小分子对接软件,如果残基较多,应该选用蛋白对接软件了啊(http://rosettadock.graylab.jhu.edu/)~~~~~
2楼2012-02-21 16:31:46
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wang-yuan

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
: Originally posted by leo1252 at 2012-02-21 16:31:46:
你的多肽大小是多少啊,如果残基较少,可以选用普通的小分子对接软件,如果残基较多,应该选用蛋白对接软件了啊(http://rosettadock.graylab.jhu.edu/)~~~~~

12个氨基酸,我的肽用荧光标记了。我用Moe软件对接了一下,发现多肽构像不对。不过也有可能我没做对。
3楼2012-02-22 19:49:54
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leo1252

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

jiaoyixiong(金币+3): 感谢,鼓励交流 2012-02-23 08:03:12
那确实挺大的,应该标记后应该更大了,感觉不怎么适合用普通软件对接了,建议用蛋白对接软件~~~~~~~~~
4楼2012-02-22 22:56:20
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