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furoc

木虫 (小有名气)

[求助] Gaussian计算NMR个别原子误差大该怎么调整

最近用gaussian计算了一个分子的碳谱，分子只含有C、H、O、N原子，大约有60个原子，用了nmr＝giao B3LYP/6-311++G(2d,p)来计算的，可是有三个碳原子的误差很大，在7－12ppm，其他都在5以下。请问有没有什么好的办法进行调整，使误差小一些。感激不尽！拜托各位了。
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1楼 2012-02-19 16:56:26
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043114076

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
gmy1990(金币+2): 2012-02-19 23:19:59
furoc(金币+7): ★★★很有帮助 非常感谢。 2012-02-20 08:30:59
不同杂化类型的C的化学位移误差是不一样的. 由于化学位移是一个相对值, 需要定标, 那么对于计算时选择标准物就没有必要使用TMS了, 选择使用同样杂化类型的分子定标误差会小很多. 我见一个文献中计算CNT的化学位移使用苯来定标, 因为他们都是sp2 的C.
自己的经验, 仅供参考和讨论
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2楼2012-02-19 23:17:28
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furoc

木虫 (小有名气)
引用回帖:
楼: Originally posted by 043114076 at 2012-02-19 23:17:28:
不同杂化类型的C的化学位移误差是不一样的. 由于化学位移是一个相对值, 需要定标, 那么对于计算时选择标准物就没有必要使用TMS了, 选择使用同样杂化类型的分子定标误差会小很多. 我见一个文献中计算CNT的化学位移 ...

但是还是有一个问题存在，因为只有个别原子误差较大，即使换个标准物，那么个别的原子误差是不是依然会很大呀。
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3楼2012-02-20 08:38:39
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043114076

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by furoc at 2012-02-20 08:38:39:
但是还是有一个问题存在，因为只有个别原子误差较大，即使换个标准物，那么个别的原子误差是不是依然会很大呀。

是的.
有这么几种可能的情况:
1. 只关注某一个C原子.
2. 比较反应前后的变化,或者一系列类似分子的变化规律
3.对于CNMR,10%的误差是正常的,是方法的问题

同样是个人理解,仅供讨论
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4楼2012-02-20 08:47:20
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furoc

木虫 (小有名气)
引用回帖:
楼: Originally posted by 043114076 at 2012-02-20 08:47:20:
是的.
有这么几种可能的情况:
1. 只关注某一个C原子.
2. 比较反应前后的变化,或者一系列类似分子的变化规律
3.对于CNMR,10%的误差是正常的,是方法的问题

同样是个人理解,仅供讨论

首先，我不太理解“只关注一个C原子”是什么意思；其次，你说的10%的误差是正常的，是方法的原因，那么这个原因是否可以改进呢；最后，就是基组对误差的影响大吗？是否可以通过改变基组来缩小误差呢？

由于是新手，问题比较低级，望海涵！
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5楼2012-02-20 09:06:21
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鱼妃

金虫 (著名写手)

挖坑不填
引用回帖:
5楼: Originally posted by furoc at 2012-02-20 09:06:21:
首先，我不太理解“只关注一个C原子”是什么意思；其次，你说的10%的误差是正常的，是方法的原因，那么这个原因是否可以改进呢；最后，就是基组对误差的影响大吗？是否可以通过改变基组来缩小误差呢？

由于是 ...

改变基组是可以的
orca提供专门的iglo-ii和iglo-iii基组计算nmr。据说iglo-iii颇为精确。
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己所不欲，勿施于人；己所欲者，亦勿施人。无论穷达，但守本分；八风不动，独善自身。
6楼2012-02-20 09:20:54
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鱼妃

金虫 (著名写手)

挖坑不填
关于orca
http://muchong.com/bbs/forumdisplay.php?fid=290&type=1101
我不是做广告的
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己所不欲，勿施于人；己所欲者，亦勿施人。无论穷达，但守本分；八风不动，独善自身。
7楼2012-02-20 09:23:08
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043114076

木虫 (正式写手)
同意鱼妃MM
不过在gauss中测试了增大基组效果并不明显
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8楼2012-02-20 12:24:37
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furoc

木虫 (小有名气)
引用回帖:
楼: Originally posted by 043114076 at 2012-02-20 12:24:37:
同意鱼妃MM
不过在gauss中测试了增大基组效果并不明显

对于一个新的软件毕竟是不熟悉啊，可能需要一段时间吧，而且相关的教程很少。
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9楼2012-02-20 15:39:57
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