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考研生涯

金虫 (正式写手)

[交流] 酶的结构 已有3人参与

对于一种新酶,怎么样能了解到他的关键位点(除了定点突变),比如说催化位点,底物结合位点等等。。。
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
1949stone(金币+1): 鼓励 2012-02-16 15:57:40
同源序列三维结构比较。
4楼2012-02-16 13:21:40
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考研生涯

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by anquren at 2012-02-16 12:14:49:
看三维结构

是一种新酶怎么看呢?能更详细点吗?
3楼2012-02-16 12:55:02
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BioChemCom

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
1949stone(MolEPI+1): 很好 很好 good 2012-02-16 15:57:51
需要做以下几件事情。
1. 通过blast或者SMART、Pfam得到这个酶的家族或者同源蛋白。

2. 通过同源蛋白的文献,我们会得到一些信息,比如:催化机理、辅酶的结合位点、金属离子的配位位点。具有这些功能的氨基酸残基,一般来说,可以通过blast得到其保守性。

3. 从同源蛋白的结构,可以建立模型,进一步理解这些氨基酸的潜在功能。从而设计突变试验,确定其可能的功能。
5楼2012-02-16 14:07:59
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