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[交流] 酶的结构已有3人参与

对于一种新酶，怎么样能了解到他的关键位点（除了定点突变），比如说催化位点，底物结合位点等等。。。

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【分子生物】EPI帖

蛋白质生物学

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1楼 2012-02-16 11:46:46

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BioChemCom

银虫 (小有名气)

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★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
1949stone(MolEPI+1): 很好很好 good 2012-02-16 15:57:51

需要做以下几件事情。
1. 通过blast或者SMART、Pfam得到这个酶的家族或者同源蛋白。

2. 通过同源蛋白的文献，我们会得到一些信息，比如：催化机理、辅酶的结合位点、金属离子的配位位点。具有这些功能的氨基酸残基，一般来说，可以通过blast得到其保守性。

3. 从同源蛋白的结构，可以建立模型，进一步理解这些氨基酸的潜在功能。从而设计突变试验，确定其可能的功能。