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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 专业学科区 » 农林 » 作物 » 求助 WinQTL catographer 的置信区间和LOD 值的设定
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baoluo

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助 WinQTL catographer 的置信区间和LOD 值的设定

各位朋友，本人最近在做QTL的定位分析，采用Permutation by 500 在p=0.01下计算所有性状的LOD阈值，最后得一个lod 值从大到小的列表，应该是选取那一行的数据呢？
通过CIM 方法，得到一张名为QTLs的列表， 表头为“Trait         Chromosome        Position        LR        Additive        Dominant  R2        LOD1_L        LOD1_R        LOD2_L        LOD2_R”置信区间怎么看呢？
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1楼 2012-02-12 18:51:49
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zdbzdb1

新虫 (初入文坛)
LOD值的阈值看QTL图中与横轴平行的那条线!

发自小木虫Android客户端
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3楼2019-06-29 23:19:48
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lixicarolyn

新虫 (初入文坛)
请问你的问题解决的吗？我有同样的疑问、
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2楼2017-03-22 10:48:05
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