24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 28666  |  回复: 22

小小佐罗2

木虫 (正式写手)

内容已删除
11楼2012-11-29 08:40:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tingzi7768

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
11楼: Originally posted by 小小佐罗2 at 2012-11-29 08:40:01
我和你的疑问相同...

呵呵,又看了一下杂志,plos one,所以这样的疑问也就。。。
12楼2012-11-29 11:34:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小小佐罗2

木虫 (正式写手)

引用回帖:
12楼: Originally posted by tingzi7768 at 2012-11-29 11:34:39
呵呵,又看了一下杂志,plos one,所以这样的疑问也就。。。...

管他什么杂志 你做的PCA这么低的贡献率 肯定要有个说法啊 想不通
13楼2012-11-30 19:51:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

a1329485280

新虫 (初入文坛)

我想问下这两个 主成分到底是什么呢
14楼2014-08-31 16:38:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

peterrjp

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

PCA的第一轴和第二轴并不一定代表某个特殊的环境参数。这两个百分数的意思就是这两个轴能分别解释所有样品中的细菌群落差异的比例。
15楼2014-10-25 15:50:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Thorn培培

新虫 (初入文坛)

楼主你好,请问PCA贡献率的问题有解决吗?我做了微生物16S rRNA测序,给的结果里面的贡献率也很低,主成分一和二累积才20多,?请问这个怎么解释啊?求指导啊。
16楼2015-12-16 22:09:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

☆季节→永恒

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

我建议楼主还是少看点PLOS one的上的文章吧,我们学校奖学金都不承认的,你懂得
17楼2015-12-24 10:59:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

416114799

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by songxc123 at 2012-02-08 15:53:31
共同学习,个人认为是这样的。
主成分分析是将所有影响因子分开,通过分析,得到不同影响因子对产生变异量(差异)的贡献率。PC1指贡献率上排名第一的贡献率,是对变异量影响最大的一个因子,8.9%的贡献率,PC2就是 ...

你的理解是错的!第一轴不是因子一,而是所有因子在一轴的投影,其他一样。如果用r语言分析,每个因子的贡献率都可以算出来。canoco我还没搞清楚。

发自小木虫IOS客户端
做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
18楼2015-12-25 08:32:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

416114799

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

请参考15楼。PCA是分析群落聚集在一起的结果如何,而这些聚集是环境因子决定的,这些因子可以是各种东西。比如pH,温度,金属浓度,有机物,有没有种植物(用0和1表示有没有),等等。因为一般要求数据是因子的三倍以上,所以大数据量才能有一个好的指示。而因子多寡不是重点,因为我们不知道环境中哪些因子影响了你的结果,如果你有5个因子,通过分析其一轴和所有轴的p值小于0.05,说明因子可以用来作图,但即便如此你也不能说所有因子有作用。你得看看各因子是否有显著,p值。如果5因子得出的一轴和/或总的p值大于0.05,说明因子有无效的。把计算得出F值最低的删掉,继续分析,直到你得到显著的p值。你看的这文章pc1和2意思是所有因子作用下群落聚类得到这样分布的可能性。因为PCA分析是空间的,不是平面的。因子影响不会只朝xy轴走,只是为了更加明白,只作出一二轴,并把它们的空间构象投影到平面。只要p值ok,一二轴数据低于80%很正常。说明作者分析的因子中只有这两个比较好解释结果,其他因子加进来p值就低于0.05,那即使解释了90%也没意义。因子五花八门,你要100个都行。但不是越多越好。你要确保的是目标数据多,而不是因子多少。所以哪怕只有一个因子理论上也行。至少结果是可靠的。至于作者图中没有很好的分离,那是另外一回事了。说明因子的确不够。有时候你测了因子,不一定就是真实有用的

发自小木虫IOS客户端
做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
19楼2015-12-25 08:52:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beforetown

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
19楼: Originally posted by 416114799 at 2015-12-25 08:52:30
请参考15楼。PCA是分析群落聚集在一起的结果如何,而这些聚集是环境因子决定的,这些因子可以是各种东西。比如pH,温度,金属浓度,有机物,有没有种植物(用0和1表示有没有),等等。因为一般要求数据是因子的三倍 ...

这个解释,貌似最详细
最靠谱了

充分说明了80%的意义

关键看p值

终于懂了(-。-
20楼2016-03-12 08:40:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 小小佐罗2 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 362求调剂 +10 我要考大 2026-04-06 14/700 2026-04-10 17:00 by luoyongfeng
[考研] 0856专硕求调剂 希望是a区院校 +21 好好休息好不好 2026-04-09 24/1200 2026-04-10 16:58 by luoyongfeng
[考研] 一志愿京区985,085401电子信息,本科电子信息 +3 阳光开朗的男孩 2026-04-10 3/150 2026-04-10 16:29 by sophia_93
[考研] 282,电气工程专业,求调剂,不挑专业 +9 jggshjkkm 2026-04-10 9/450 2026-04-10 14:55 by 逆水乘风
[考研] 材料复试求调剂 +20 xhhdjdjsjks 2026-04-09 20/1000 2026-04-10 10:25 by 孙小小12457
[考研] 材料专硕283求调剂 +18 试试看呗 2026-04-04 19/950 2026-04-10 10:05 by may_新宇
[考研] 调剂 +4 青灯不负 2026-04-09 4/200 2026-04-10 09:55 by LHGeng
[考研] 086003调剂求助 +19 苏弋万 2026-04-09 20/1000 2026-04-09 20:48 by bljnqdcc
[考研] 284求调剂 +8 让我上岸吧阿西 2026-04-09 10/500 2026-04-09 18:34 by 段伟艳
[硕博家园] 有没有学校材料专业收跨调(一志愿085410) +5 momo(上岸版) 2026-04-06 8/400 2026-04-09 15:07 by only周
[考研] 286求调剂 +19 Faune 2026-04-08 20/1000 2026-04-09 08:36 by 哦哦123
[考研] 求调剂 +11 wwwwabcde 2026-04-07 11/550 2026-04-07 23:16 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂(085602,过四级,一志愿985) +25 化工人999 2026-04-04 26/1300 2026-04-07 22:06 by hemengdong
[论文投稿] Decision: Revise for Editor还会送审吗 100+3 CccccccccFD 2026-04-04 5/250 2026-04-07 10:58 by 北京莱茵润色
[考研] 信工所11408 340分 本科西安交大自动化 +3 moontrek 2026-04-06 3/150 2026-04-07 09:56 by chongya
[考研] 求调剂 +4 电气小神童 2026-04-04 6/300 2026-04-07 00:14 by guanxin1001
[考研] 工科 22408 267求推荐 +4 wanwan00 2026-04-05 5/250 2026-04-06 22:47 by chenzhimin
[考研] 一志愿211生物学280分 求调剂 +5 李rien 2026-04-05 5/250 2026-04-06 10:30 by zhyzzh
[考研] 284求调剂 +7 徐同学_001 2026-04-04 13/650 2026-04-05 17:19 by yulian1987
[考研] 309求调剂 +4 快乐的小白鸽 2026-04-04 5/250 2026-04-04 15:55 by cql1109
信息提示
请填处理意见