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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » PCA分析的图看不懂 找高手来解释下
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小小佐罗2

木虫 (正式写手)

[求助] PCA分析的图看不懂 找高手来解释下 已有5人参与

这个图看不懂 PC1（8.9%）是第一主成分，PC2（8.5%）为第二主成分，谁能详细解释下这2个百分数的含义。
附原文：The first two principal components explain 17.4% of variance.
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1楼 2012-02-07 22:06:47
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peterrjp

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

PCA的第一轴和第二轴并不一定代表某个特殊的环境参数。这两个百分数的意思就是这两个轴能分别解释所有样品中的细菌群落差异的比例。
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15楼2014-10-25 15:50:08
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小小佐罗2

木虫 (正式写手)
顶上去 没人知道么
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2楼2012-02-08 11:47:13
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songxc123

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
共同学习，个人认为是这样的。
主成分分析是将所有影响因子分开，通过分析，得到不同影响因子对产生变异量（差异）的贡献率。PC1指贡献率上排名第一的贡献率，是对变异量影响最大的一个因子，8.9%的贡献率，PC2就是排名第二的因子的贡献率是8.5%。
个人认为这个贡献率不是很高，一般我看了几篇文献，有的前2个主成分可以占到80%以上的贡献率。
纯属个人见解，欢迎高手指点！
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3楼2012-02-08 15:53:31
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小小佐罗2

木虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by songxc123 at 2012-02-08 15:53:31:
共同学习，个人认为是这样的。
主成分分析是将所有影响因子分开，通过分析，得到不同影响因子对产生变异量（差异）的贡献率。PC1指贡献率上排名第一的贡献率，是对变异量影响最大的一个因子，8.9%的贡献率，PC2就 ...

那我想继续请问 这2个主成分贡献率加起来才17.4%，一般要求最少要大于80%啊，这块想不明白
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4楼2012-02-08 19:15:00
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