应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » openmpi安装问题
182/2返回列表上一页12
查看: 3792  |  回复: 17
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

iamikaruk

木虫 (著名写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by souledge at 2012-02-09 16:11:49:
直到上个月才借了个26个node的超级古老集群以普通用户权限使用的路过～根本没有机会玩mpi的连接～

一般集群都会给你配置好，只要用任务提交系统就可以了吧
赞一下 回复此楼
[img]http://osu.ppy.sh/stat2/iamikaruk-0.png[/img]
11楼2012-02-09 21:01:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)
liliangfang(金币+2): 多谢指教 2012-02-12 16:31:40
引用回帖:
11楼: Originally posted by iamikaruk at 2012-02-09 21:01:22:
一般集群都会给你配置好，只要用任务提交系统就可以了吧

问题就是没配置好，使用的古老四年前的Fedora系统，2007年的gfortran，MPICH2 1.2……
结果就是编译PWscf虽然能通过，但是运行ph.x就会直接iotk错误……
编译的elk暂时没有问题～
无法编译VASP～
只能编译Abinit 6.1左右时间的版本～并且还得自己修改点Abinit的源代码，否则无法通过编译～
于是自己只能用自己的限制账户在自己的目录下尝试安装PGI编译器和新版本的mpich2，并且屏蔽掉非用户目录中的公用mpi，然后想办法试试能否把nodes串起来～反正是各种错误～相当崩溃……
赞一下 回复此楼
思想重于技巧，内涵重于表象
12楼2012-02-09 22:21:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

iamikaruk

木虫 (著名写手)
引用回帖:
12楼: Originally posted by souledge at 2012-02-09 22:21:38:
问题就是没配置好，使用的古老四年前的Fedora系统，2007年的gfortran，MPICH2 1.2……
结果就是编译PWscf虽然能通过，但是运行ph.x就会直接iotk错误……
编译的elk暂时没有问题～
无法编译VASP～
只能编译Ab ...

那么老的系统，就算能够跑起来也是投入/产出不成比例啊
赞一下 回复此楼
[img]http://osu.ppy.sh/stat2/iamikaruk-0.png[/img]
13楼2012-02-10 08:54:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)
引用回帖:
13楼: Originally posted by iamikaruk at 2012-02-10 08:54:53:
那么老的系统，就算能够跑起来也是投入/产出不成比例啊

没别的办法，总比我自己的一台1090T要快吧……
赞一下 回复此楼
思想重于技巧，内涵重于表象
14楼2012-02-10 10:39:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shelay

木虫 (正式写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by lianghust at 2012-02-09 20:08:45:
configure的时候加： --disable-openib

我试试
回复此楼
15楼2012-02-12 14:01:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shelay

木虫 (正式写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by lianghust at 2012-02-09 20:08:45:
configure的时候加： --disable-openib

你好，我按照你的建议在configure的时候加入--disable-openib-rdmacm，安装后没有出现CMA: unable to get RDMA device list提示了，但是其它还在：[686,1],0]: A high-performance Open MPI point-to-point messaging module
was unable to find any relevant network interfaces:

Module: OpenFabrics (openib)
  Host: localhost.localdomain

Another transport will be used instead, although this may result in
lower performance.
--------------------------------------------------------------------------
Hello, world, I am            2  of            4
Hello, world, I am            0  of            4
Hello, world, I am            3  of            4
Hello, world, I am            1  of            4
[localhost.localdomain:02654] 3 more processes have sent help message help-mpi-btl-base.txt / btl:no-nics
[localhost.localdomain:02654] Set MCA parameter "orte_base_help_aggregate" to 0 to see all help / error messages
请问怎么解决阿？
赞一下 回复此楼
16楼2012-02-12 14:27:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lianghust

铁杆木虫 (正式写手)
liliangfang(金币+1): 多谢指教 2012-02-12 16:32:03
引用回帖:
16楼: Originally posted by shelay at 2012-02-12 14:27:50:
你好，我按照你的建议在configure的时候加入--disable-openib-rdmacm，安装后没有出现CMA: unable to get RDMA device list提示了，但是其它还在：[686,1],0]: A high-performance Open MPI point-to-point mess ...

你加--disable-openib试试，或者在运行的时候加参数走以太网：

mpirun -np 16 -machinefile ma  --mca btl self,tcp  yourprogram
赞一下 回复此楼
17楼2012-02-12 14:48:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dxf_dxf_dxf

银虫 (小有名气)
引用回帖:
17楼: Originally posted by lianghust at 2012-02-12 14:48:12:
你加--disable-openib试试，或者在运行的时候加参数走以太网：

mpirun -np 16 -machinefile ma  --mca btl self,tcp  yourprogram

请问能否详细解释一下“--mca btl self,tcp”这个选项的意思？
我在使用intel mpi时，user guide提到要选择网络类型，包括sock（TCP、以太网、套接字）shm（仅共享内存，无套接字）ssm（TCP+共享内存，对通过“以太网”进行连接的SMP群集）、RDMA（通过制定的DAPL）、RDSSM
我想知道，在openmpi里面如何选择相应的网络结构？
如何知道我的网络结构支持以上哪些？
以上这些结构的性能好坏排序？
如果我的网络不支持rdma和rdssm，是因为硬件原因还是软件原因？在我没有管理员权限的情况下，能否通过安装软件来使我的网络支持rdma和rdssm？
rdma和rdssm的性能比ssm要好么？好多少？
赞一下 回复此楼
18楼2012-04-23 14:15:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 shelay 的主题更新
182/2返回列表上一页12
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 070300化学319求调剂 +5 锦鲤0909 2026-03-17 5/250 2026-03-18 10:21 by macy2011
[考研] 304求调剂 +11 小熊joy 2026-03-14 12/600 2026-03-18 09:59 by macy2011
[考研] 302求调剂 +9 呼呼呼。。。。 2026-03-17 9/450 2026-03-18 09:34 by zhukairuo
[考研] 材料专硕326求调剂 +6 墨煜姒莘 2026-03-15 7/350 2026-03-17 17:10 by ruiyingmiao
[考研] 一志愿苏州大学材料工程（085601）专硕有科研经历三项国奖两个实用型专利一项省级立项 +6 大火山小火山 2026-03-16 8/400 2026-03-17 15:05 by 无懈可击111
[考研] 材料工程专硕274一志愿211求调剂 +6 薛云鹏 2026-03-15 6/300 2026-03-17 11:05 by 学员h26Tkc
[考研] 0854控制工程 359求调剂 可跨专业 +3 626776879 2026-03-14 9/450 2026-03-16 17:42 by 626776879
[考研] 化学调剂0703 +8 啊我我的 2026-03-11 8/400 2026-03-16 17:23 by 我的船我的海
[考博] 东华理工大学化材专业26届硕士博士申请 +6 zlingli 2026-03-13 6/300 2026-03-15 20:00 by ryzcf
[考研] 0856专硕279求调剂 +5 加油加油！? 2026-03-15 5/250 2026-03-15 11:58 by 2020015
[考研] 中科大材料与化工319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:10 by ms629
[考研] 304求调剂 +6 Mochaaaa 2026-03-12 7/350 2026-03-13 22:18 by 星空星月
[考研] 304求调剂 +7 7712b 2026-03-13 7/350 2026-03-13 21:42 by peike
[考研] 四川大学085601材料工程专硕 初试294求调剂 +4 祝我们好在冬天 2026-03-11 4/200 2026-03-13 21:39 by peike
[考研] 一志愿211化学学硕310分求调剂 +8 努力奋斗112 2026-03-12 9/450 2026-03-13 15:41 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +7 ADT 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:17 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +3 是Lupa啊 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:30 by 求调剂zz
[考研] 0817化学工程与技术考研312分调剂 +3 T123 tt 2026-03-12 3/150 2026-03-13 10:49 by houyaoxu
[考研] 290求调剂 +3 ADT 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:19 by peike
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-03-12 4/200 2026-03-12 19:33 by 求调剂zz
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭