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shelay

木虫 (正式写手)

[求助] openmpi安装问题

我要安装vasp,在openmpi1.4.3安装完成后进行测试出现下面的错误信息:
root@localhost examples]#  mpirun -np 4  /root/Desktop/ziliao/openmpi-1.4.3/examples/hello_f90
librdmacm: couldn't read ABI version.
librdmacm: assuming: 4
CMA: unable to get RDMA device list
--------------------------------------------------------------------------
[[23253,1],0]: A high-performance Open MPI point-to-point messaging module
was unable to find any relevant network interfaces:

Module: OpenFabrics (openib)
  Host: localhost.localdomain

Another transport will be used instead, although this may result in
lower performance.
--------------------------------------------------------------------------
librdmacm: couldn't read ABI version.
librdmacm: couldn't read ABI version.
librdmacm: assuming: 4
CMA: unable to get RDMA device list
librdmacm: assuming: 4
CMA: unable to get RDMA device list
librdmacm: couldn't read ABI version.
librdmacm: assuming: 4
CMA: unable to get RDMA device list
Hello, world, I am            0  of            4
Hello, world, I am            2  of            4
Hello, world, I am            1  of            4
Hello, world, I am            3  of            4
[localhost.localdomain:21029] 3 more processes have sent help message help-mpi-btl-base.txt / btl:no-nics
[localhost.localdomain:21029] Set MCA parameter "orte_base_help_aggregate" to 0 to see all help / error messages
请问各位大侠我的安装正确不?不正确的话怎么消除这些信息呢?先谢谢各位了!
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souledge

专家顾问 (著名写手)

liliangfang(金币+2): 多谢指教 2012-02-12 16:31:40
引用回帖:
11楼: Originally posted by iamikaruk at 2012-02-09 21:01:22:
一般集群都会给你配置好,只要用任务提交系统就可以了吧

问题就是没配置好,使用的古老四年前的Fedora系统,2007年的gfortran,MPICH2 1.2……
结果就是编译PWscf虽然能通过,但是运行ph.x就会直接iotk错误……
编译的elk暂时没有问题~
无法编译VASP~
只能编译Abinit 6.1左右时间的版本~并且还得自己修改点Abinit的源代码,否则无法通过编译~
于是自己只能用自己的限制账户在自己的目录下尝试安装PGI编译器和新版本的mpich2,并且屏蔽掉非用户目录中的公用mpi,然后想办法试试能否把nodes串起来~反正是各种错误~相当崩溃……
思想重于技巧,内涵重于表象
12楼2012-02-09 22:21:38
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iamikaruk

木虫 (著名写手)

WDD880227(金币+1): 感谢交流 2012-02-12 14:40:32
楼主的集群应该不是用infiniband做通讯的吧,openmpi默认用infiniband相关参数,因此如果是普通ethernet的话要加udapl参数。具体我忘记了,楼主可以google一下
[img]http://osu.ppy.sh/stat2/iamikaruk-0.png[/img]
3楼2012-02-08 22:14:04
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souledge

专家顾问 (著名写手)


liliangfang(金币+1): 多谢提示 2012-02-09 10:44:24
引用回帖:
3楼: Originally posted by iamikaruk at 2012-02-08 22:14:04:
楼主的集群应该不是用infiniband做通讯的吧,openmpi默认用infiniband相关参数,因此如果是普通ethernet的话要加udapl参数。具体我忘记了,楼主可以google一下

看LZ的软件安装再/root下,并且主机名就是默认的localhost,应该是单机玩的,不是TCP/IP做的集群,更不可能是Infiniband做的集群了~
思想重于技巧,内涵重于表象
4楼2012-02-08 23:26:45
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iamikaruk

木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by souledge at 2012-02-08 23:26:45:
看LZ的软件安装再/root下,并且主机名就是默认的localhost,应该是单机玩的,不是TCP/IP做的集群,更不可能是Infiniband做的集群了~

只看了楼主的错误,没有仔细看楼主的运行
[img]http://osu.ppy.sh/stat2/iamikaruk-0.png[/img]
5楼2012-02-09 10:34:50
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